120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1785 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  96.5 
 
 		 405 aa  781    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  84.25 
 
 		 400 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 414 aa  834    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  78.3 
 
 		 401 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  92.44 
 
 		 405 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  79.43 
 
 		 410 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  73.74 
 
 		 408 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  52.47 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  53.14 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  52.86 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  51.04 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  51.94 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  50.79 
 
 		 407 aa  342  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  52.74 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  48.72 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  48.21 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  47.96 
 
 		 398 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  46.7 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  43.91 
 
 		 420 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  45.04 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  44.73 
 
 		 459 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  43.42 
 
 		 410 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  43.42 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  42.16 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  43.22 
 
 		 419 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  44.47 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  46.51 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  42.29 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  42.13 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  44.09 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  45.87 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  41.75 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  39.14 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  38.96 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  38.73 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  37.4 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  35.34 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  37.47 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  36.08 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  36.29 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  37.5 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  36.55 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  36.68 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  35.26 
 
 		 364 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  33.87 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  35.66 
 
 		 404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  34.33 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  34.38 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  32.56 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  41 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  37.5 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  31.99 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  32.89 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  35.44 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  34.25 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.26 
 
 		 386 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  29.17 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  30.19 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  29.33 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  30.62 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  30.87 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  27.95 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  31.19 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  26.49 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  26.39 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  34.62 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  34.62 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  34.62 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  27.81 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  31.22 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  31.16 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  24.69 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  23.2 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  31.03 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.76 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.55 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  22.99 
 
 		 492 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  26 
 
 		 462 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  29.72 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  27.53 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  25.49 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  24.59 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  28.02 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  31.28 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  27.7 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  26.48 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  25.94 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  23.89 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  28.25 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  28.25 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  28.25 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  33.94 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  25.34 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  37.89 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  31.46 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  31.36 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  31.34 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  26.61 
 
 		 467 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  25.67 
 
 		 456 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  26.7 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>