102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0574 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 394 aa  780    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  73.23 
 
 		 404 aa  564  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  66.92 
 
 		 414 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  61.81 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  37.56 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  37.4 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  39.18 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  35.06 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  38.66 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  39.49 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  40.26 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  38.02 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  37.24 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  37.08 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  36.29 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  38.28 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  36.01 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  35.84 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  38.24 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  36.29 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  35.09 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  38.44 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  37.31 
 
 		 407 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  33.59 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  35.95 
 
 		 409 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  35.81 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  35.38 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  34.04 
 
 		 410 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  34.04 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  35.77 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  35.42 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  35.84 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  33.84 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  34.67 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  34.04 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  35.58 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  33.25 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  33.51 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  32.56 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  29.89 
 
 		 415 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  31.07 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  39.41 
 
 		 386 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  30.99 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.87 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  31.93 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  31.35 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  31.73 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  33.6 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  31.94 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  33.24 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.95 
 
 		 401 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  30.91 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  30.79 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  32.28 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.46 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  32.04 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  34.2 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  29.9 
 
 		 389 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  35.57 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  29.37 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  37.21 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  29.32 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  27.3 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  36.62 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  28.72 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  28.16 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  34.3 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  27.35 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  31.64 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  29.29 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  27.66 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  27.66 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  27.47 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  24.02 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  23.68 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  26.49 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  25.5 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  22.77 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  24.71 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  26.79 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  29.94 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  32.34 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  34.58 
 
 		 475 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  27.04 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  26.25 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  27.33 
 
 		 512 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  26.13 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  28.33 
 
 		 507 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  31.34 
 
 		 466 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  31.34 
 
 		 466 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  30 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  31.53 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  26.7 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  32.24 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  29.71 
 
 		 447 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  22.16 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  27.39 
 
 		 489 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  29.75 
 
 		 444 aa  46.2  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  25.76 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  27.78 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>