112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1760 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  100 
 
 
419 aa  843    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  72.49 
 
 
420 aa  591  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  63.83 
 
 
427 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  64.76 
 
 
398 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  65.08 
 
 
398 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  65.49 
 
 
398 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  49.09 
 
 
418 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  48.8 
 
 
403 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  47.74 
 
 
394 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  47.95 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  43.47 
 
 
405 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  43.85 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  43.85 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  48.24 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  43.61 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  43.42 
 
 
408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  44.05 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  46.31 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  48.98 
 
 
421 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  46.67 
 
 
407 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  40.9 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  41.22 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  41.22 
 
 
410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  41.71 
 
 
460 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  40.41 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  40.82 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  41.03 
 
 
411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  41.43 
 
 
393 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  39.59 
 
 
404 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  38.63 
 
 
428 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  38.85 
 
 
409 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  39.75 
 
 
389 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  38.78 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  36.5 
 
 
401 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  36.64 
 
 
404 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  36.76 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  36.29 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  38.52 
 
 
380 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  37.12 
 
 
424 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  31.84 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  35.53 
 
 
414 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  37.53 
 
 
404 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  34.74 
 
 
379 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  36.48 
 
 
415 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  31.82 
 
 
386 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  36.67 
 
 
375 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  34.57 
 
 
370 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  33.25 
 
 
379 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  36.39 
 
 
398 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  33.85 
 
 
364 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  35.5 
 
 
385 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  36.72 
 
 
371 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  32.11 
 
 
389 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  33.06 
 
 
419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  42.56 
 
 
401 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.55 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  29.9 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  39.29 
 
 
364 aa  117  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  29.56 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  27.98 
 
 
372 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.8 
 
 
401 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.29 
 
 
400 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  39.04 
 
 
392 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  35.02 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  29.36 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  21.82 
 
 
444 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  35.32 
 
 
422 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  35.32 
 
 
422 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  35.32 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  29.4 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  31.9 
 
 
455 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  29.69 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  25.88 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  31.14 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  25.32 
 
 
342 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  30.72 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  31.1 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  25.35 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  28.82 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  22.87 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  25.82 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  23 
 
 
468 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  27.54 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  27.1 
 
 
467 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  28.49 
 
 
445 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  27.81 
 
 
480 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  27.81 
 
 
480 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  27.81 
 
 
480 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  28.99 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  27.44 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  31.52 
 
 
466 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  27.95 
 
 
466 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  25.83 
 
 
460 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  26.28 
 
 
462 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  31.18 
 
 
444 aa  60.5  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  25.86 
 
 
481 aa  60.1  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  29.59 
 
 
478 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  26.03 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  28.77 
 
 
512 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  23.9 
 
 
462 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>