275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5802 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5802  allantoate amidohydrolase  100 
 
 
428 aa  832    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587062  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5813  allantoate amidohydrolase  47.41 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734094  normal  0.203308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2278  allantoate amidohydrolase  46.65 
 
 
421 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3091  allantoate amidohydrolase  43.55 
 
 
426 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.60133  normal  0.601215 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3446  allantoate amidohydrolase  43.31 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3434  allantoate amidohydrolase  46.25 
 
 
423 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147071  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  42.93 
 
 
429 aa  252  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2051  allantoate amidohydrolase  44.15 
 
 
425 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.423886  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1768  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 
418 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.67714  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5680  allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
438 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00010355  normal  0.0526524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5903  allantoate amidohydrolase  38.15 
 
 
438 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00734582  hitchhiker  0.00704513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.08 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  30.81 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  30.73 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  38.4 
 
 
417 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  33.81 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33 
 
 
415 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  31.89 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 
425 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  31.88 
 
 
428 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 
591 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 
425 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  34.92 
 
 
422 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  32.51 
 
 
427 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  32.77 
 
 
423 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  32.93 
 
 
423 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  37.21 
 
 
418 aa  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  32.6 
 
 
412 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  34.11 
 
 
431 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  32.19 
 
 
420 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  32.1 
 
 
427 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  31.33 
 
 
422 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  32.34 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  34.26 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  34.4 
 
 
426 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  32.84 
 
 
406 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.77 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  31.54 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.1 
 
 
431 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  29.18 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.36 
 
 
426 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.36 
 
 
426 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  32.3 
 
 
423 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  34.52 
 
 
426 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.3 
 
 
424 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  32.28 
 
 
416 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  27.55 
 
 
447 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  30.47 
 
 
411 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  30.26 
 
 
411 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 
430 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  30.67 
 
 
429 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  34.23 
 
 
591 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.33 
 
 
410 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  36.22 
 
 
412 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  31.58 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  31.58 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  35.97 
 
 
592 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  30.26 
 
 
429 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.32 
 
 
420 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30 
 
 
427 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.86 
 
 
415 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.84 
 
 
419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  32.43 
 
 
423 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  31.12 
 
 
411 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.12 
 
 
430 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  29.55 
 
 
421 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.14 
 
 
589 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  32.51 
 
 
427 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  30.93 
 
 
417 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  33.09 
 
 
442 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  29.88 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  34.85 
 
 
433 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  37.44 
 
 
424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  31.12 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  30.86 
 
 
425 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  33.14 
 
 
589 aa  136  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  30.62 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  30 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  30.3 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.25 
 
 
599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.01 
 
 
593 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  32.27 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  28.96 
 
 
412 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  32.32 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  27.74 
 
 
415 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  29.38 
 
 
413 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  30.45 
 
 
429 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  29.98 
 
 
427 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  31.86 
 
 
416 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  29.66 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>