277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3091 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3091  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.60133  normal  0.601215 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3446  allantoate amidohydrolase  98.83 
 
 		 426 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2051  allantoate amidohydrolase  86.76 
 
 		 425 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.423886  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3434  allantoate amidohydrolase  75.43 
 
 		 423 aa  581  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5813  allantoate amidohydrolase  48.12 
 
 		 418 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734094  normal  0.203308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2278  allantoate amidohydrolase  46.76 
 
 		 421 aa  315  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  45.29 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5802  allantoate amidohydrolase  43.06 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587062  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5680  allantoate amidohydrolase  39.8 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00010355  normal  0.0526524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5903  allantoate amidohydrolase  38.76 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00734582  hitchhiker  0.00704513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1768  allantoate amidohydrolase  36.86 
 
 		 418 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.67714  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  32.35 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.69 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33.81 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  34.3 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.02 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  35.03 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.66 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  31.45 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  33.09 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  35.13 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.18 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  30.41 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.8 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  36.9 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.39 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  34.53 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  36.11 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1155  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 420 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2217  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1308  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2536  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2078  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0986595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0702  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1147  allantoate amidohydrolase  35.62 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  30.37 
 
 		 411 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.51 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  31.25 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  32.49 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  30.75 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.16 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.27 
 
 		 426 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.27 
 
 		 426 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  31.6 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  32.05 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  30.69 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  30.73 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  32.03 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  30.73 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  30.73 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  30.73 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  30.75 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  30.73 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.33 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  29.88 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  29.74 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  32.45 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.64 
 
 		 416 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.47 
 
 		 447 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  30.71 
 
 		 409 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  34.99 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  32.21 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  34.02 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  31.86 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  31.49 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  31.86 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  32.37 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  33.01 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  31.86 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  30.75 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  29.43 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  32.33 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  31.71 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.75 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  28.82 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  31.49 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  30.29 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  35.79 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  30.29 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  30.29 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  30.29 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  31.67 
 
 		 429 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  29.52 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  32.52 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  30.91 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  31.15 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.92 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  31.94 
 
 		 429 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  31.77 
 
 		 423 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  34.47 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1412  allantoate amidohydrolase  36.02 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  29.52 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  30.05 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  30.83 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  28.5 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>