278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2278 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2278  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 421 aa  849    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5813  allantoate amidohydrolase  49.75 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734094  normal  0.203308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  46.19 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5680  allantoate amidohydrolase  42.51 
 
 		 438 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00010355  normal  0.0526524 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3091  allantoate amidohydrolase  46.76 
 
 		 426 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.60133  normal  0.601215 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5903  allantoate amidohydrolase  42.51 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00734582  hitchhiker  0.00704513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3446  allantoate amidohydrolase  46.28 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5802  allantoate amidohydrolase  46.62 
 
 		 428 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587062  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2051  allantoate amidohydrolase  46.97 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.423886  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3434  allantoate amidohydrolase  46.08 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1768  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.67714  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.1 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 409 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  34.34 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  34.34 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  34.76 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  34.09 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  34.51 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  34.98 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.2 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.24 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.4 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4001  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00670775  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  34.38 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  31.57 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  38.59 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.31 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.31 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  34.85 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  33.8 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.67 
 
 		 407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  33.77 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  35.34 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.83 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  35.03 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  32.93 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  38.07 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.07 
 
 		 415 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  32.14 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.97 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.33 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  34.81 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6670  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.84 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  34.72 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  34.95 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  31.75 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  31.46 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.41 
 
 		 594 aa  153  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  32.62 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  31.14 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  32.17 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  32.52 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  34.46 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1266  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0327  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  34.55 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.46 
 
 		 523 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03707  beta-alanine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12670)  31.04 
 
 		 502 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  30.51 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.22 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  31.46 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  34.55 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  34.4 
 
 		 591 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  30.51 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  30.96 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  32.71 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.75 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  33.16 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  31.35 
 
 		 426 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5774  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.99 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  31.59 
 
 		 426 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  32.09 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  32.99 
 
 		 430 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.22 
 
 		 421 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  31.4 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  30.43 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  32.75 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  28.72 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.39 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.1 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.89 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>