More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2709 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1290  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  86.92 
 
 
409 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.223029  normal  0.133177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1363  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  89.74 
 
 
392 aa  707    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2709  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  803    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0391766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03965  two-component system regulatory protein  54.94 
 
 
448 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2132  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.87 
 
 
336 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5424  sigma-54 dependent transcriptional regulator  49.06 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2494  response regulator receiver protein  56 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  51.95 
 
 
668 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1743  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  51.42 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0362051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5443  two-component response regulator CbrB  52.17 
 
 
477 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1825  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  51.64 
 
 
336 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.760782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  51.52 
 
 
668 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.28 
 
 
333 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62540  two-component response regulator CbrB  52.17 
 
 
478 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349279  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0831  response regulator receiver:sigma-54 factor, interaction region  52.89 
 
 
494 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  52.89 
 
 
478 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1528  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.68 
 
 
479 aa  238  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.163365  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51 
 
 
458 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0839917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0098  Fis family transcriptional regulator  49.27 
 
 
510 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3589  two-component response regulator CbrB  51.74 
 
 
477 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42680  sigma54-dependent response regulator, CbrB  51.3 
 
 
466 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  49.8 
 
 
472 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0737  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.74 
 
 
479 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000126889 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2187  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  52.23 
 
 
456 aa  236  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4695  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.74 
 
 
480 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1807  two component Fis family transcriptional regulator  51.8 
 
 
440 aa  235  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.15 
 
 
459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2041  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  52.61 
 
 
455 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  50.8 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.3 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4808  two-component response regulator CbrB  51.3 
 
 
478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069592  hitchhiker  0.0095877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0498  two component response regulator  54.42 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2569  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  53.98 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.393427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2721  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  52.89 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.3 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1603  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.77 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2158  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.41 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5583  Fis family transcriptional regulator  47.45 
 
 
508 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468143  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3609  putative transcriptional regulator  47.99 
 
 
503 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2763  transcriptional regulator ZraR  52.89 
 
 
445 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2825  transcriptional regulator ZraR  52.89 
 
 
445 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.479389  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2938  transcriptional regulator ZraR  52.89 
 
 
445 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0247  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  53.47 
 
 
493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.82 
 
 
456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  51.5 
 
 
486 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  52.54 
 
 
664 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.6 
 
 
453 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03284  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator, Fis family protein  45.98 
 
 
453 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2804  transcriptional regulatory protein ZraR  52.89 
 
 
445 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2057  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.22 
 
 
448 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2771  two component Fis family transcriptional regulator  56.19 
 
 
449 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0590  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.72 
 
 
440 aa  232  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2707  sigma-54 dependent response regulator  52.44 
 
 
444 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1331  Fis family transcriptional regulator  44.89 
 
 
415 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.373385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.15 
 
 
453 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2839  sigma-54 dependent response regulator  52.44 
 
 
444 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2707  sigma-54 dependent response regulator  52.44 
 
 
444 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 
471 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2050  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.57 
 
 
511 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.155124  hitchhiker  0.000156568 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2955  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator, putative  54.08 
 
 
457 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4272  sigma-54 dependent response regulator  47.97 
 
 
457 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1960  response regulator transcription factor  53.1 
 
 
471 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2563  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  52.59 
 
 
480 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1032  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.67 
 
 
461 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1625  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.55 
 
 
544 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0165781  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.48 
 
 
456 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2568  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  54.08 
 
 
457 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0491002  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.91 
 
 
456 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1713  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  52.65 
 
 
460 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.91858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0944  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.51 
 
 
480 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3295  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.79 
 
 
452 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42970  putative transcriptional regulator  47.62 
 
 
503 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.076623  normal  0.105875 
 
 
-
 
NC_002950  PG0148  sigma-54-dependent transcriptional regulator  48.03 
 
 
417 aa  230  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02446  predicted DNA-binding response regulator in two-component system  52 
 
 
444 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1114  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  52 
 
 
444 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.922386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1123  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  52 
 
 
444 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.66 
 
 
458 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.385665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1527  Fis family transcriptional regulator  45.17 
 
 
537 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3196  Fis family transcriptional regulator  51 
 
 
494 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02410  hypothetical protein  52 
 
 
444 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2919  sigma-54 dependent response regulator  52 
 
 
444 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3788  sigma-54 dependent response regulator  52 
 
 
444 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4025  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  49.36 
 
 
532 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1228  Fis family transcriptional regulator  44.4 
 
 
549 aa  229  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0689  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.3 
 
 
544 aa  229  8e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.430174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  53.6 
 
 
452 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3698  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  48.74 
 
 
526 aa  229  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1377  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49 
 
 
473 aa  229  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490125  normal  0.921369 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0282  transcriptional regulator NifA  44.48 
 
 
525 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.262632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1361  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  48.38 
 
 
744 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  52.44 
 
 
684 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1152  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.9 
 
 
488 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0888361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2855  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  47.62 
 
 
582 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6499  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.22 
 
 
458 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6734  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.22 
 
 
458 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321079  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05873  nitric oxide reductase regulator  51.11 
 
 
542 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1593  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.53 
 
 
378 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.43 
 
 
456 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1259  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.19 
 
 
445 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3629  two-component system response regulator  49.19 
 
 
445 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>