88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0140 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3692  stringent starvation protein B  25.84 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4423  stringent starvation protein B  29.17 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4117  ClpXP protease specificity-enhancing factor  28.12 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0928  ClpXP protease specificity-enhancing factor  28.12 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5499  stringent starvation protein B  26.23 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2968  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.63 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.816462  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1938  ClpXP protease specificity-enhancing factor  28.12 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3017  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0478052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0255  ClpXP protease specificity-enhancing factor  28.12 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.262631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2105  ClpXP protease specificity-enhancing factor  31.96 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.054144  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0756  Stringent starvation protein B  29.17 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0793  stringent starvation protein B  29.17 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24426  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2204  stringent starvation protein B  24.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4688  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.04 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170007  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4403  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.04 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1321  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.04 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2870  stringent starvation protein B  28.41 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.338758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1876  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.11 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1941  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.11 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4528  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3197  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.67 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0825  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.08 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0109  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.9 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2466  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.24 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2658  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.11 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3794  Stringent starvation protein B  25.51 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  24.86 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0748969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  28.12 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3159  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.8 
 
 		 133 aa  47.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3303  ClpXP protease specificity-enhancing factor  24.71 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2193  hypothetical protein  27.52 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  0.0422844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0574  ClpXP protease specificity-enhancing factor  22.68 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.07602  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0805  ClpXP protease specificity-enhancing factor  22.68 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000656077  hitchhiker  0.00760563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1521  Stringent starvation protein B  28.12 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0302  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.03 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0800734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13100  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2397  stringent starvation protein B  34.18 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.672505  normal  0.042037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1204  Stringent starvation protein B  23.56 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1958  ClpXP protease specificity-enhancing factor  28.87 
 
 		 130 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.188367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004505  stringent starvation protein B  28.24 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000252533  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1587  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.93 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  20.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.16 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0605  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444219  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3089  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0463  ClpXP protease specificity-enhancing factor  24.86 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3636  Stringent starvation protein B  24.74 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4346  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.8 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00332207  hitchhiker  0.00737983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1131  ClpXP protease specificity-enhancing factor  24.49 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000374711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0264  stringent starvation protein B  28.95 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119829  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0717  ClpXP protease specificity-enhancing factor  23.96 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.288679  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4162  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0156887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0129  stringent starvation protein B  28.71 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0606  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000126975  normal  0.116605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0527  ClpXP protease specificity-enhancing factor  24.49 
 
 		 171 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03199  stringent starvation protein B  24.05 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000635662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2215  Stringent starvation protein B  27.08 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143233 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0139  Stringent starvation protein B  27.08 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.253376  normal  0.0968579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3702  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0753  ClpXP protease specificity-enhancing factor  28.57 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.749535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3885  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0903466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3759  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0566  ClpXP protease specificity-enhancing factor  21.65 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000750893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0418  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1001  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3540  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190354  normal  0.0891932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4545  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00795203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03039  hypothetical protein  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0478  Stringent starvation protein B  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3272  ClpXP protease specificity-enhancing factor  20.62 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03088  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  24.07 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214233  normal  0.191438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2207  ClpXP protease specificity-enhancing factor  30.39 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3663  ClpXP protease specificity-enhancing factor  24.49 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.163839  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3548  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3417  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3710  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0478  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000881621  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4999  ClpXP protease specificity-enhancing factor  23.96 
 
 		 137 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57520  ClpXP protease specificity-enhancing factor  23.96 
 
 		 135 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3523  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25.77 
 
 		 165 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000608482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3270  hypothetical protein  26.26 
 
 		 172 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0612  ClpXP protease specificity-enhancing factor  20.62 
 
 		 145 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0934  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2739  ClpXP protease specificity-enhancing factor  25 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4436  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.63 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.889879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>