20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2193 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2193  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  0.0422844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0140  hypothetical protein  27.27 
 
 		 182 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3794  Stringent starvation protein B  27.87 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3636  Stringent starvation protein B  31.46 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  32.65 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4162  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.63 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0156887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.94 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0805  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.27 
 
 		 152 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000656077  hitchhiker  0.00760563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1365  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.93 
 
 		 150 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3197  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.55 
 
 		 152 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2870  stringent starvation protein B  28.4 
 
 		 137 aa  45.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.338758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1958  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.06 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.188367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0574  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.82 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.07602  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2204  stringent starvation protein B  33.68 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3017  ClpXP protease specificity-enhancing factor  26.32 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0478052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1876  ClpXP protease specificity-enhancing factor  31.63 
 
 		 138 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1941  ClpXP protease specificity-enhancing factor  31.63 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0612  ClpXP protease specificity-enhancing factor  27.27 
 
 		 145 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0605  ClpXP protease specificity-enhancing factor  29.85 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444219  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  30.33 
 
 		 137 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>