126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1001 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1001  ClpXP protease specificity-enhancing factor  100 
 
 		 142 aa  296  9e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3540  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.34 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190354  normal  0.0891932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0418  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1204  Stringent starvation protein B  54.33 
 
 		 197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3226  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.65 
 
 		 165 aa  143  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3089  ClpXP protease specificity-enhancing factor  58.77 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0363  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.77 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5499  stringent starvation protein B  49.64 
 
 		 176 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3692  stringent starvation protein B  59.05 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0372  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.64 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.785538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2739  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.46 
 
 		 159 aa  141  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3543  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.54 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2855  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.22 
 
 		 165 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.408921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2925  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.22 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0717  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.54 
 
 		 188 aa  140  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3202  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.22 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  0.769041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2694  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.62 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.843962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3260  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.62 
 
 		 173 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1809  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.62 
 
 		 173 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2744  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.62 
 
 		 173 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3671  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.62 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3646  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.62 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3703  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.62 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2662  ClpXP protease specificity-enhancing factor  58 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.467258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0445  ClpXP protease specificity-enhancing factor  58 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.91 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0127228  hitchhiker  0.00000353694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0348  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.04 
 
 		 173 aa  139  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1829  ClpXP protease specificity-enhancing factor  57.72 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2973  ClpXP protease specificity-enhancing factor  55.77 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2968  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.79 
 
 		 175 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.816462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3931  stringent starvation protein B  58.16 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0825  ClpXP protease specificity-enhancing factor  56.73 
 
 		 185 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1406  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.31 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0813  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.54 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284281  hitchhiker  0.000260876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0756  Stringent starvation protein B  50.43 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0264  stringent starvation protein B  46.04 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119829  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0793  stringent starvation protein B  52.38 
 
 		 178 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24426  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0934  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.48 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0853  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.08 
 
 		 178 aa  123  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0129  stringent starvation protein B  42.75 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1587  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.2 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.8 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214233  normal  0.191438 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0139  Stringent starvation protein B  40.15 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.253376  normal  0.0968579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2466  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.6 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0755  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.61 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0556951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2207  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.42 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13100  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.73 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3159  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.38 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3523  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000608482  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03088  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0478  Stringent starvation protein B  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03039  hypothetical protein  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3697  stringent starvation protein B  40.41 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2105  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.88 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.054144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3663  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.52 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.163839  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0792  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.65 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.198285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3417  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3710  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0478  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000881621  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4545  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00795203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3548  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.15 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0606  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.23 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000126975  normal  0.116605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.23 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.288679  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0605  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.23 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444219  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3017  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.86 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0478052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3197  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.31 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0566  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.81 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000750893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0753  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.749535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0612  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.23 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3702  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.81 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3759  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.81 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3885  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.81 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0903466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1941  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.95 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0255  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.85 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.262631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1938  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.85 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2215  Stringent starvation protein B  37.32 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2658  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.55 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3639  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.67 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0402989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3534  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.67 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0546582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3604  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.67 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0530098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.67 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00341096  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3701  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.67 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2204  stringent starvation protein B  40.65 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3272  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.81 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0190  stringent starvation protein B  42.86 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0369  Stringent starvation protein B  42.86 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.539363  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.81 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1876  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.18 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.57 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4999  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.46 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4117  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.75 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4346  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.9 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00332207  hitchhiker  0.00737983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57520  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.85 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4436  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.889879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1131  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.17 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000374711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0527  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.17 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.32 
 
 		 146 aa  95.9  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3303  ClpXP protease specificity-enhancing factor  34.44 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0463  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.71 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1365  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.62 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>