126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0129 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0129  stringent starvation protein B  100 
 
 		 135 aa  283  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04048  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0139  Stringent starvation protein B  88.89 
 
 		 135 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.253376  normal  0.0968579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2925  ClpXP protease specificity-enhancing factor  59.23 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2855  ClpXP protease specificity-enhancing factor  58.14 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.408921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3089  ClpXP protease specificity-enhancing factor  69.7 
 
 		 162 aa  156  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3226  ClpXP protease specificity-enhancing factor  69.31 
 
 		 165 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3202  ClpXP protease specificity-enhancing factor  68.32 
 
 		 165 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  0.769041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0853  ClpXP protease specificity-enhancing factor  67 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0717  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.5 
 
 		 188 aa  153  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0934  ClpXP protease specificity-enhancing factor  65.98 
 
 		 185 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2968  ClpXP protease specificity-enhancing factor  64.15 
 
 		 175 aa  150  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.816462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3692  stringent starvation protein B  68 
 
 		 199 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5499  stringent starvation protein B  70.1 
 
 		 176 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0825  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.38 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0756  Stringent starvation protein B  62.75 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3540  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.17 
 
 		 169 aa  143  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190354  normal  0.0891932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0793  stringent starvation protein B  62.75 
 
 		 178 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24426  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1204  Stringent starvation protein B  64.95 
 
 		 197 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2694  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.33 
 
 		 175 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.843962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3260  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.33 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1809  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.33 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2744  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.33 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3671  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.33 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3931  stringent starvation protein B  60.19 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3646  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.33 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3703  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.33 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2739  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.38 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0418  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.54 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2973  ClpXP protease specificity-enhancing factor  57.63 
 
 		 170 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2662  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.63 
 
 		 173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.467258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0363  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.63 
 
 		 173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143816  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0445  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.63 
 
 		 173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0348  ClpXP protease specificity-enhancing factor  61.62 
 
 		 173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0372  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.63 
 
 		 173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.785538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3543  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.63 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  62.63 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0127228  hitchhiker  0.00000353694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0813  ClpXP protease specificity-enhancing factor  56.86 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284281  hitchhiker  0.000260876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1406  ClpXP protease specificity-enhancing factor  54.39 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1829  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.85 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0264  stringent starvation protein B  44.37 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119829  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1001  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.75 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03199  stringent starvation protein B  41.18 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000635662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3159  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.97 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3697  stringent starvation protein B  45.39 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1587  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.36 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2105  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.43 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.054144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4423  stringent starvation protein B  41.48 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219018  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.97 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214233  normal  0.191438 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0255  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.78 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.262631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1938  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.78 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4117  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.02 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3663  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.7 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.163839  normal  0.173019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03088  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0478  Stringent starvation protein B  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2629  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.86 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03039  hypothetical protein  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4545  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00795203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2207  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.52 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3759  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.78 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011866  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0463  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.04 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845722  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3417  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3710  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3702  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.78 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3885  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.78 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0903466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0527  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.04 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0478  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000881621  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3523  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000608482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3548  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.13 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1958  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.18 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.188367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3197  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.73 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0574  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.81 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.07602  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0792  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.27 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.198285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0566  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.2 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000750893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2756  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.11 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.74 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4403  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.12 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.26 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1321  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.12 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0928  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.08 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3303  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.73 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13100  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.1 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2466  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.35 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0753  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.749535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.36 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0748969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0302  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.36 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0800734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57520  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.35 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4999  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.35 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1131  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.42 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000374711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4688  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170007  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3794  Stringent starvation protein B  43.93 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3272  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.99 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4528  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.15 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3636  Stringent starvation protein B  43.93 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3701  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.08 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3604  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.08 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0530098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.08 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00341096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3534  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.08 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0546582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3639  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.08 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0402989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4346  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.04 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00332207  hitchhiker  0.00737983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>