126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1521 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1521  Stringent starvation protein B  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2870  stringent starvation protein B  51.38 
 
 		 137 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.338758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0928  ClpXP protease specificity-enhancing factor  55.34 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1321  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.88 
 
 		 153 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13100  ClpXP protease specificity-enhancing factor  53.4 
 
 		 135 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4403  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.88 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4117  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.46 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.66 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0748969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4423  stringent starvation protein B  51.46 
 
 		 137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2204  stringent starvation protein B  40 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.39 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57520  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.52 
 
 		 135 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4999  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.52 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2658  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.07 
 
 		 151 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2466  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.49 
 
 		 141 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0302  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.73 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0800734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4688  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.52 
 
 		 137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170007  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3697  stringent starvation protein B  49.06 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4528  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.98 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3636  Stringent starvation protein B  39.74 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3017  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.03 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0478052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03199  stringent starvation protein B  35.68 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000635662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2215  Stringent starvation protein B  49.02 
 
 		 144 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3794  Stringent starvation protein B  41.84 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2397  stringent starvation protein B  47.71 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.672505  normal  0.042037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2756  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.06 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2629  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.06 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1587  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.36 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0463  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.93 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845722  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0755  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.69 
 
 		 151 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0556951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1131  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.93 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000374711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0527  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.93 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0793  stringent starvation protein B  39.66 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24426  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.61 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004505  stringent starvation protein B  38.29 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000252533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0753  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.02 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.749535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3159  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.36 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3303  ClpXP protease specificity-enhancing factor  34.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0109  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.6 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00887  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.04 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0756  Stringent starvation protein B  39.11 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.78 
 
 		 146 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214233  normal  0.191438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.46 
 
 		 134 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1958  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.44 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.188367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3523  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000608482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0255  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.08 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.262631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1938  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.08 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03088  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0478  Stringent starvation protein B  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0717  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.55 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4545  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00795203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03039  hypothetical protein  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3417  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3710  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0478  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000881621  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3548  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0612  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.52 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0605  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.52 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444219  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4162  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.14 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0156887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0574  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.52 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.07602  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3663  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.44 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.163839  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3702  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.65 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0566  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.65 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000750893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3759  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.65 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3885  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.65 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0903466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0606  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.71 
 
 		 145 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000126975  normal  0.116605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.71 
 
 		 145 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.288679  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3931  stringent starvation protein B  46.15 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3272  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.52 
 
 		 145 aa  97.4  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2207  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.28 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0805  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.24 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000656077  hitchhiker  0.00760563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4436  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.08 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.889879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1829  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48 
 
 		 132 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3197  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.09 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4346  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.08 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00332207  hitchhiker  0.00737983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3692  stringent starvation protein B  49.49 
 
 		 199 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3534  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.52 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0546582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3701  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.52 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3639  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.52 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0402989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3604  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.52 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0530098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.52 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00341096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1876  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43 
 
 		 138 aa  94.7  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5499  stringent starvation protein B  36.61 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1941  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43 
 
 		 144 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3540  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.52 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190354  normal  0.0891932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2105  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.45 
 
 		 142 aa  94  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.054144  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0792  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.9 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.198285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0264  stringent starvation protein B  39.32 
 
 		 141 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119829  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1204  Stringent starvation protein B  34.74 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1365  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.8 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0813  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40.74 
 
 		 143 aa  91.3  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284281  hitchhiker  0.000260876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2968  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.15 
 
 		 175 aa  91.3  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.816462  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3226  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.96 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1406  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.69 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2973  ClpXP protease specificity-enhancing factor  36.16 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0825  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.92 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0129  stringent starvation protein B  41.32 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3202  ClpXP protease specificity-enhancing factor  34.68 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  0.769041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3089  ClpXP protease specificity-enhancing factor  34.1 
 
 		 162 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>