46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3270 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3270  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  343  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2731  hypothetical protein  71.75 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3359  hypothetical protein  73.56 
 
 		 194 aa  250  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.363359  normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2352  hypothetical protein  68.31 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4013  protein of unknown function DUF1321  70.79 
 
 		 178 aa  240  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2031  hypothetical protein  72.16 
 
 		 174 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6105  hypothetical protein  75.43 
 
 		 175 aa  234  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1418  hypothetical protein  52.28 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2662  hypothetical protein  48.15 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.950467  normal  0.462988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2889  protein of unknown function DUF1321  48.85 
 
 		 217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547275  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2784  protein of unknown function DUF1321  47.49 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.297905  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4523  hypothetical protein  49.28 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0771  hypothetical protein  52.97 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1361  hypothetical protein  48.15 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2803  protein of unknown function DUF1321  50.56 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1404  hypothetical protein  47.62 
 
 		 189 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2446  hypothetical protein  51.15 
 
 		 160 aa  173  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0697  protein of unknown function DUF1321  47.62 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0730761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2544  protein of unknown function DUF1321  49.13 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1773  hypothetical protein  45.41 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1982  hypothetical protein  47.83 
 
 		 177 aa  170  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0705433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1093  hypothetical protein  65.52 
 
 		 208 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2027  hypothetical protein  47.4 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2824  hypothetical protein  49.14 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.000998025  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0599  protein of unknown function DUF1321  46.96 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0962477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2041  hypothetical protein  46.03 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0930  hypothetical protein  44.38 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1450  hypothetical protein  46.71 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2205  hypothetical protein  44.31 
 
 		 196 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00100691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1005  hypothetical protein  42.94 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3150  hypothetical protein  51.69 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3359  hypothetical protein  44.12 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0703032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2716  hypothetical protein  40.83 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2333  hypothetical protein  45.12 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0025839  normal  0.298167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0722  hypothetical protein  41.57 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2139  hypothetical protein  51.82 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0813  hypothetical protein  51.82 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1336  hypothetical protein  51.33 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2391  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1909  hypothetical protein  38.55 
 
 		 153 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1150  protein of unknown function DUF1321  46.09 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0462  hypothetical protein  40.29 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0325  hypothetical protein  31.18 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000000262702  n/a   
 
 
 
NC_002978  WD0128  hypothetical protein  40.59 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.547253  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0744  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000544943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0140  hypothetical protein  26.26 
 
 		 182 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000284712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>