More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0462 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0462  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2772  ABC transporter related  65.04 
 
 		 269 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05950  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  53.08 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1930  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6474  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  52.1 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0774668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 587 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0889  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.61 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 		 548 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  51.41 
 
 		 540 aa  235  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0137  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 		 339 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.57 
 
 		 350 aa  234  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  47.49 
 
 		 531 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  48.43 
 
 		 552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4352  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 		 329 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50.8 
 
 		 534 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  50.6 
 
 		 557 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  51.14 
 
 		 532 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  48.79 
 
 		 557 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  50 
 
 		 539 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1009  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933664  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0951  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  48.63 
 
 		 548 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.17 
 
 		 610 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  49.58 
 
 		 539 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  48.36 
 
 		 553 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  48.74 
 
 		 531 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  46.9 
 
 		 611 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 536 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  49.58 
 
 		 539 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.276741  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 536 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  46.69 
 
 		 544 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2959  ABC transporter related  51.01 
 
 		 599 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  45.08 
 
 		 640 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  46.54 
 
 		 548 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5644  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  49.37 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  47.76 
 
 		 550 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3079  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.5 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  48.21 
 
 		 619 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  47.35 
 
 		 534 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  48.8 
 
 		 543 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4863  ABC transporter ATP-binding protein, putative oligo/dipeptide transport protein  47.17 
 
 		 335 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.14 
 
 		 596 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  48.8 
 
 		 543 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  50.21 
 
 		 541 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0982  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.45 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  48.05 
 
 		 524 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2856  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.843723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  45.08 
 
 		 623 aa  222  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  50.62 
 
 		 530 aa  222  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2700  ABC oligo/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  48.3 
 
 		 659 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  49.18 
 
 		 545 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 		 543 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 564 aa  222  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  43.94 
 
 		 624 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.88 
 
 		 525 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  50.84 
 
 		 537 aa  221  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  46.9 
 
 		 540 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  50.61 
 
 		 571 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.32 
 
 		 623 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  47.3 
 
 		 609 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  47.88 
 
 		 525 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  47.31 
 
 		 544 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.09 
 
 		 571 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  47.29 
 
 		 536 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  48.35 
 
 		 544 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  47.64 
 
 		 543 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  46.51 
 
 		 540 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  48.63 
 
 		 532 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  47.64 
 
 		 545 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  47.64 
 
 		 545 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  51.36 
 
 		 536 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 338 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3645  ABC transporter related  47.89 
 
 		 599 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  45.72 
 
 		 533 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  47.27 
 
 		 579 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  50 
 
 		 533 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  48.08 
 
 		 533 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6465  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  47.51 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  46.12 
 
 		 540 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 620 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  45.7 
 
 		 547 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 		 544 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1618  ABC transporter related  46.49 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  46.69 
 
 		 530 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  47.92 
 
 		 542 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3616  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 		 356 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 		 338 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  46.92 
 
 		 549 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0612  oligopeptide transporter ATP-binding component  46.04 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  48.76 
 
 		 539 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1000  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  49.16 
 
 		 545 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6268  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3251  ABC transporter-related protein  48.08 
 
 		 570 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 544 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  46.88 
 
 		 527 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 703 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  45.82 
 
 		 542 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>