More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05950  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  100 
 
 		 265 aa  511  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1930  ABC transporter related  65.13 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 536 aa  254  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 536 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  48.86 
 
 		 534 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  50.2 
 
 		 547 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  53.33 
 
 		 542 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  52.81 
 
 		 539 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  52.81 
 
 		 539 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  51.18 
 
 		 542 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  50 
 
 		 537 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4716  ABC transporter related  52.8 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 		 347 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 347 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  52.38 
 
 		 539 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0462  ABC transporter related  52.47 
 
 		 268 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  52.38 
 
 		 545 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 		 347 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3924  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  55.08 
 
 		 587 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 		 703 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  48.81 
 
 		 548 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  52.55 
 
 		 542 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  52.55 
 
 		 542 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 564 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 545 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0012  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  49.61 
 
 		 543 aa  234  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1182  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.7 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00551018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  54.37 
 
 		 539 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.71 
 
 		 596 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49 
 
 		 671 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  50.42 
 
 		 609 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5644  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.48 
 
 		 331 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.46 
 
 		 553 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 		 342 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 		 353 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.31 
 
 		 525 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  46.92 
 
 		 525 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.45 
 
 		 610 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5119  putative ABC transporter ATP-binding  47.64 
 
 		 327 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  0.157884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  50 
 
 		 343 aa  230  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  53.15 
 
 		 571 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 563 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  44.74 
 
 		 619 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2744  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.02 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.76985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 		 545 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 		 708 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1695  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.57 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000898255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  48.82 
 
 		 545 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6090  ABC transporter related  52.42 
 
 		 532 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 330 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.15 
 
 		 329 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 609 aa  229  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0129  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.57 
 
 		 334 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  46.88 
 
 		 542 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0137  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.63 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  48.41 
 
 		 530 aa  228  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4131  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.67 
 
 		 337 aa  228  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  48.4 
 
 		 548 aa  228  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 		 329 aa  228  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 		 550 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4338  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.21 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0306947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 		 348 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0785342  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 		 353 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 		 541 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2451  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.38 
 
 		 326 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  47.66 
 
 		 537 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5346  ABC transporter related  51.36 
 
 		 536 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173896  normal  0.0532745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 		 327 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4352  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.22 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  47.35 
 
 		 533 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  46.44 
 
 		 557 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1396  ABC transporter related  50.61 
 
 		 537 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6952  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  47.64 
 
 		 545 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5164  ABC transporter related  47.64 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  48.24 
 
 		 533 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0991  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1010  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  48.02 
 
 		 619 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  47.64 
 
 		 537 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>