More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1930 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1930  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05950  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  65.13 
 
 		 265 aa  340  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4716  ABC transporter related  52.36 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  47.88 
 
 		 525 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  49.01 
 
 		 542 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  46.99 
 
 		 534 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2643  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 		 327 aa  241  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.791522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 		 536 aa  241  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 		 536 aa  241  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.49 
 
 		 525 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  46.44 
 
 		 542 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  49.6 
 
 		 545 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  46.44 
 
 		 542 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 		 548 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  48.03 
 
 		 537 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2772  ABC transporter related  51.19 
 
 		 269 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.57 
 
 		 357 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  48.08 
 
 		 539 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  48.08 
 
 		 531 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  48.08 
 
 		 539 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  50.76 
 
 		 530 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  48.08 
 
 		 539 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  47.64 
 
 		 543 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  45.91 
 
 		 542 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.53 
 
 		 545 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1182  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00551018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  46.95 
 
 		 530 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1838  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.39 
 
 		 344 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  43.24 
 
 		 547 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1494  ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 530 aa  232  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.475677  normal  0.971253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2789  ABC transporter related  45.42 
 
 		 530 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.12 
 
 		 339 aa  231  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755562  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2714  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 530 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.74 
 
 		 610 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  46.18 
 
 		 530 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1063  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000893655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.02 
 
 		 703 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 		 545 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0868  dipeptide transport ATP-binding protein DppD  45.53 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 		 337 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.276741  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.62 
 
 		 596 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5164  ABC transporter related  48.06 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  47.2 
 
 		 527 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0137  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.74 
 
 		 339 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  47.21 
 
 		 542 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 545 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 530 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.75 
 
 		 543 aa  228  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  46.83 
 
 		 543 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.62 
 
 		 332 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  47.53 
 
 		 332 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632882  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.34 
 
 		 555 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  44.36 
 
 		 545 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  46.83 
 
 		 543 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 536 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  47.69 
 
 		 539 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.84 
 
 		 530 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  46.69 
 
 		 545 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  48.26 
 
 		 533 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  47.6 
 
 		 537 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0462  ABC transporter related  50 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  44.79 
 
 		 541 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 548 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  45.67 
 
 		 545 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  44.58 
 
 		 588 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  50 
 
 		 557 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2146  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0012  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.59 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4352  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.8 
 
 		 543 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  45.04 
 
 		 547 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  44.54 
 
 		 553 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.24 
 
 		 536 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  47.24 
 
 		 537 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0127  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 527 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  44.19 
 
 		 550 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  44.66 
 
 		 538 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  47.22 
 
 		 548 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 609 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  44.71 
 
 		 533 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  45.63 
 
 		 543 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0879  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 		 338 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  43.82 
 
 		 522 aa  224  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 539 aa  224  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  45.67 
 
 		 536 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0771  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.02 
 
 		 326 aa  224  9e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  42.06 
 
 		 564 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  42.8 
 
 		 542 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  45.59 
 
 		 527 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 564 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0129  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.38 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  45.11 
 
 		 553 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2856  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.843723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  43.98 
 
 		 531 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>