246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1180 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1180  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
281 aa  548  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2101  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  75.63 
 
 
280 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.614547  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0568  hypothetical protein  66.43 
 
 
285 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.949446  hitchhiker  0.00210733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0702  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.11 
 
 
286 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0121  energy conserving hydrogenase A integral membrane subunit  44.49 
 
 
292 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.42064  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1216  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.7 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0768  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.25 
 
 
292 aa  209  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0366  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.61 
 
 
294 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1099  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.91 
 
 
290 aa  89  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.457086  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0151  ech hydrogenase subunit B  31.44 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.25 
 
 
319 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.8 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0025  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.37 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.9 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  28.3 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0363  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.33 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2652  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.67 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.21 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07230  ech hydrogenase subunit B  29.31 
 
 
290 aa  79  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00126519  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2725  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  34.43 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144854  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
353 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  31.55 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  31.07 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2502  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.04 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1083  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  34.02 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0148591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1731  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  32.85 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0032732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.73 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0550  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.25 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1519  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.71 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.52 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3370  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.33 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  32.04 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  29.71 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  29.13 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.42 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.73 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.03 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4115  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.74 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  28.51 
 
 
333 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0779  ech hydrogenase subunit B  28.71 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.928258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  26.34 
 
 
939 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_764  hydrogenase, EchB subunit  29.21 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.34 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1740  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  26.46 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1571  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.09 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.165543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  27.31 
 
 
432 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.77 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  28.12 
 
 
447 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  30.19 
 
 
333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  30.69 
 
 
372 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  30.69 
 
 
372 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3023  ech hydrogenase subunit B  28.25 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0539405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  27.23 
 
 
447 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  29.7 
 
 
342 aa  59.7  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.05 
 
 
343 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  26.18 
 
 
448 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.26 
 
 
312 aa  59.3  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  24.78 
 
 
349 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  28.44 
 
 
372 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  28.71 
 
 
372 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  28.71 
 
 
372 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.39 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1672  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.83 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  29.7 
 
 
372 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  30.2 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  30.2 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  29.25 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  30.2 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  29.21 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0861  hydrogenase, EchB subunit, putative  28.22 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  28.43 
 
 
372 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  29.52 
 
 
347 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  30.29 
 
 
347 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2971  formate hydrogenlyase, subunit D  28.32 
 
 
307 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  28.16 
 
 
447 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  30.14 
 
 
347 aa  55.8  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  28.71 
 
 
341 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  28.1 
 
 
449 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  28.37 
 
 
384 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  27.43 
 
 
372 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3037  formate hydrogenlyase subunit D  28.32 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217312 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  27.72 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  27.43 
 
 
372 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  29.33 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  26.82 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3002  formate hydrogenlyase subunit D  28.32 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  27.43 
 
 
372 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3053  formate hydrogenlyase subunit D  28.32 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3160  formate hydrogenlyase, subunit D  28.32 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.184477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>