More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2725 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2725  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144854  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0363  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  72.16 
 
 
292 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0025  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  62.86 
 
 
285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3023  ech hydrogenase subunit B  54.64 
 
 
291 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0539405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  57.61 
 
 
282 aa  322  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4115  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  57.99 
 
 
307 aa  315  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2652  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  59.29 
 
 
293 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1731  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  55.81 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0032732  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1623  ech hydrogenase subunit B  54.21 
 
 
289 aa  295  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1571  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.81 
 
 
289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.165543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  49.27 
 
 
939 aa  279  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07230  ech hydrogenase subunit B  49.12 
 
 
290 aa  278  6e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00126519  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0151  ech hydrogenase subunit B  47.5 
 
 
287 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1519  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.69 
 
 
282 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3370  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.86 
 
 
283 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2502  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.69 
 
 
282 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1083  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.65 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0148591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1672  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.48 
 
 
283 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1099  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.04 
 
 
290 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.457086  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0779  ech hydrogenase subunit B  44.79 
 
 
282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.928258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_764  hydrogenase, EchB subunit  45.63 
 
 
282 aa  212  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0550  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.7 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0861  hydrogenase, EchB subunit, putative  44.4 
 
 
282 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  33.47 
 
 
333 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.72 
 
 
313 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.91 
 
 
319 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.96 
 
 
300 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  30 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.56 
 
 
343 aa  96.3  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1186  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.8 
 
 
315 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2616  hydrogenase-4 component C  31.8 
 
 
315 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3705  hydrogenase-4 component C  31.8 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438396  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.96 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.21 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2765  hydrogenase-4 component C  31.17 
 
 
314 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00950  formate hydrogenlyase subunit 4  25.66 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  28.62 
 
 
322 aa  89.7  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.2 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2630  hydrogenase-4 component C  32.08 
 
 
315 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2855  hydrogenase-4 component C  30.29 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.95 
 
 
323 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  28.24 
 
 
330 aa  85.9  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0131  hydrogenase-4 component C  25.66 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2971  formate hydrogenlyase, subunit D  25.58 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.04 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.04 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3037  formate hydrogenlyase subunit D  25.58 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3053  formate hydrogenlyase subunit D  25.58 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3002  formate hydrogenlyase subunit D  25.58 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3160  formate hydrogenlyase, subunit D  25.58 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.184477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.71 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  27.5 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3973  formate hydrogenlyase, subunit D  25 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0967  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0990  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0456069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2847  formate hydrogenlyase, subunit D  25 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.115372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2858  formate hydrogenlyase, subunit D  25 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3010  formate hydrogenlyase, subunit D  25 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3154  formate hydrogenlyase, subunit D  25.68 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2190  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.91 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.552986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02572  hydrogenase 3, membrane subunit  25 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02537  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25.18 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.9 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.33 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1790  hydrogenase-4 component C  24.73 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00154252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2475  NADH dehydrogenase  27.16 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1913  hypothetical protein  24.65 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2709  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  23.33 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1284  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25.97 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0584834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  26.44 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  26.21 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1261  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  26.6 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2431  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25.26 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  29.66 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.38 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  26.78 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1690  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  26.27 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
440 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  26.9 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.949446  hitchhiker  0.00210733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1397  formate hydrogenlyase subunit 4-like protein  28.78 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3195  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.78 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  26.64 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1126  formate hydrogenlyase subunit 4  26.69 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.519574  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.43 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  23.55 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2101  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.97 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.614547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1180  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.65 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  25.82 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0167  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.98 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  30.58 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  26.01 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.76 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0930  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.68 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150795  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.67 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  25.78 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  28.26 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  28.97 
 
 
432 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>