More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1083 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1083  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 
286 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0148591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3370  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  60.38 
 
 
283 aa  339  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0025  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.45 
 
 
285 aa  285  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1519  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.95 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2502  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.59 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0151  ech hydrogenase subunit B  47.52 
 
 
287 aa  280  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2725  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.36 
 
 
285 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144854  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0363  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.21 
 
 
292 aa  279  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.631394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1731  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.25 
 
 
286 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0032732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3023  ech hydrogenase subunit B  48.04 
 
 
291 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0539405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.25 
 
 
282 aa  258  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1672  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.84 
 
 
283 aa  258  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1099  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.29 
 
 
290 aa  255  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.457086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2652  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.65 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4115  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.31 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0550  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.73 
 
 
288 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_764  hydrogenase, EchB subunit  51.15 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0779  ech hydrogenase subunit B  50.38 
 
 
282 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.928258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1623  ech hydrogenase subunit B  45.19 
 
 
289 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0861  hydrogenase, EchB subunit, putative  49.62 
 
 
282 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1571  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.87 
 
 
289 aa  228  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.165543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  42.34 
 
 
939 aa  225  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07230  ech hydrogenase subunit B  43.89 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00126519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  30.17 
 
 
333 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  32.23 
 
 
338 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.92 
 
 
343 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.08 
 
 
303 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.08 
 
 
303 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.05 
 
 
332 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.23 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.54 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  32.58 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02572  hydrogenase 3, membrane subunit  27.15 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02537  hypothetical protein  27.15 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  28.38 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1186  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.62 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2616  hydrogenase-4 component C  28.62 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.61 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1557  NADH dehydrogenase subunit H  29.1 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000661956  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0967  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.02 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1743  NADH dehydrogenase subunit H  28.93 
 
 
332 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.693854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0990  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.02 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0456069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2847  formate hydrogenlyase, subunit D  26.82 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.115372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2858  formate hydrogenlyase, subunit D  27.02 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3010  formate hydrogenlyase, subunit D  27.02 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1923  NADH dehydrogenase subunit H  28.93 
 
 
332 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.13 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2971  formate hydrogenlyase, subunit D  26.73 
 
 
307 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2765  hydrogenase-4 component C  28.62 
 
 
314 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3154  formate hydrogenlyase, subunit D  26.49 
 
 
307 aa  89  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3037  formate hydrogenlyase subunit D  26.73 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3002  formate hydrogenlyase subunit D  26.73 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3053  formate hydrogenlyase subunit D  26.73 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3195  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.49 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3160  formate hydrogenlyase, subunit D  26.73 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.184477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3705  hydrogenase-4 component C  28.3 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438396  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2431  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  26.48 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3973  formate hydrogenlyase, subunit D  26.49 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.18 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2855  hydrogenase-4 component C  27.97 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0702  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.95 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1284  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  26.62 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0584834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  27.24 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0768  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.25 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2190  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.17 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.552986 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  24.91 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.37 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1216  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.27 
 
 
286 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  24.66 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.05 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0131  hydrogenase-4 component C  22.18 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.82 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0121  energy conserving hydrogenase A integral membrane subunit  32.33 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.42064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  27.09 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  27.94 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  27.78 
 
 
322 aa  79  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00950  formate hydrogenlyase subunit 4  23.64 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  26.6 
 
 
343 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25 
 
 
349 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2709  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25.09 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  28.52 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1438  NADH dehydrogenase subunit H  26.23 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2630  hydrogenase-4 component C  30.28 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1690  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.73 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0366  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.17 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1790  hydrogenase-4 component C  24.47 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00154252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1261  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.07 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  26.27 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  25.68 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  26.83 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1913  hypothetical protein  24.82 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  29.48 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.78 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2544  NADH dehydrogenase subunit H  29.44 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38434  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  27.56 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1180  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.02 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2101  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.39 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.614547  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  29.08 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>