More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1099 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1099  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
290 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.457086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0550  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  61.27 
 
 
288 aa  328  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3370  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  53.08 
 
 
283 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2502  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.46 
 
 
282 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1519  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.1 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0151  ech hydrogenase subunit B  46.38 
 
 
287 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_764  hydrogenase, EchB subunit  52.31 
 
 
282 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0779  ech hydrogenase subunit B  52.31 
 
 
282 aa  251  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.928258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0861  hydrogenase, EchB subunit, putative  52.31 
 
 
282 aa  248  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0363  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.8 
 
 
292 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.631394  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2725  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.16 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144854  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1083  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.65 
 
 
286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0148591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1672  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.72 
 
 
283 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1731  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  44.85 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0032732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0025  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.53 
 
 
285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4115  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.2 
 
 
307 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  43.97 
 
 
939 aa  222  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3023  ech hydrogenase subunit B  41.01 
 
 
291 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0539405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1623  ech hydrogenase subunit B  41.55 
 
 
289 aa  222  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2652  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.04 
 
 
293 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1571  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.18 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.165543 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.35 
 
 
282 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07230  ech hydrogenase subunit B  40.91 
 
 
290 aa  202  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00126519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  33.61 
 
 
333 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  28.23 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.09 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.8 
 
 
332 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  32.23 
 
 
323 aa  92.8  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.14 
 
 
293 aa  92  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.96 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2971  formate hydrogenlyase, subunit D  30.38 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3195  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.4 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.69 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3160  formate hydrogenlyase, subunit D  30.03 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.184477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3002  formate hydrogenlyase subunit D  30.03 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3053  formate hydrogenlyase subunit D  30.03 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3037  formate hydrogenlyase subunit D  30.03 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.33 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.33 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  28.36 
 
 
322 aa  89  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0967  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.38 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3010  formate hydrogenlyase, subunit D  30.38 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0990  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.38 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0456069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2858  formate hydrogenlyase, subunit D  30.38 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2847  formate hydrogenlyase, subunit D  30.38 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.115372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02572  hydrogenase 3, membrane subunit  30.38 
 
 
307 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3154  formate hydrogenlyase, subunit D  30.03 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02537  hypothetical protein  30.38 
 
 
307 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.63 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.8 
 
 
313 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0131  hydrogenase-4 component C  25.45 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2101  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.67 
 
 
280 aa  85.9  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.614547  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3973  formate hydrogenlyase, subunit D  30.95 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.23 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.52 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  26.53 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.41 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2616  hydrogenase-4 component C  33.63 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.62 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1186  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  33.63 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.41 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3705  hydrogenase-4 component C  33.63 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438396  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2765  hydrogenase-4 component C  33.63 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.41 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  27.72 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2431  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.45 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00950  formate hydrogenlyase subunit 4  25.4 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0568  hypothetical protein  31.56 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.949446  hitchhiker  0.00210733 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.34 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1073  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.47 
 
 
322 aa  79  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  26.12 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2855  hydrogenase-4 component C  32.74 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0366  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.23 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25.77 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  27.02 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2190  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.21 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.552986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.31 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  29.27 
 
 
449 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  26.67 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  27.43 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  26.89 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0106  putative NADH dehydrogenase I chain H  29.35 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1180  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.44 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2630  hydrogenase-4 component C  32.99 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.5 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0161254  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  26.48 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.96 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  27.49 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  23.72 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1397  formate hydrogenlyase subunit 4-like protein  28.89 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  25.72 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>