More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2048 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 		 324 aa  619  1e-176  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  76.6 
 
 		 323 aa  449  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  70.79 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  74.42 
 
 		 320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  42.06 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.594505 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  44.83 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  43.52 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  42.09 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.96 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.96 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  38.72 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  42.19 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.59 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.97 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  32.29 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  36.48 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  36.16 
 
 		 353 aa  158  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  33.85 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  36.16 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  31.52 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  31.52 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  32.83 
 
 		 384 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  32.42 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  33.54 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  34.85 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  32.7 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  32.7 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  33.88 
 
 		 372 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  34.93 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  32.39 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  34.93 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  35.53 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  35.05 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  33.73 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  33.73 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  32.57 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  31.78 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  32.67 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  32.12 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.7 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  31.33 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  31.33 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  33.12 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  31.21 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  33.65 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.53 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.22 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  32.21 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  32.19 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.27 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.56 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1597  NADH dehydrogenase (quinone)  36.52 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  34.59 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  32.15 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  31.92 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  33.79 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  33.79 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  31.51 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5972  NADH dehydrogenase (quinone)  35.37 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723565  normal  0.842062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  32.67 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  33.33 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.32 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  31.21 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  34.52 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  34.84 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  35.37 
 
 		 345 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3408  F420H2 dehydrogenase subunit H  32.2 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00645372  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  35.16 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.11 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  30.79 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  30.6 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  31.53 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  30.63 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  32.54 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  30.89 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.62 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  30.57 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  34.84 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.56 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>