110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2878 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2878  Phospholipid-binding protein-like protein  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.965435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3280  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  30.9 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  31.07 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  38.66 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  37.07 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  30.34 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  27.47 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  31.54 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  31.15 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  34.38 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  34.38 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  39.05 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  32.74 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  26.92 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  38.89 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  24.31 
 
 
185 aa  61.6  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  31.34 
 
 
154 aa  61.2  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  39.39 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  29.93 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  33.64 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  31.93 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  36.19 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  28.67 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  30.83 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  33.87 
 
 
200 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  34.29 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0344  PEBP family protein  35.07 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  28.57 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  31.2 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  28.23 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  31.45 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  32.8 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  28.06 
 
 
149 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  30.08 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  30.77 
 
 
179 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  30.33 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  26.97 
 
 
153 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  30.33 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  27.86 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  30.66 
 
 
617 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  28.93 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0357  Phospholipid-binding protein  30.33 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  27.87 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  23.64 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  27.13 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  28.36 
 
 
156 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  30.91 
 
 
158 aa  52  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  33.05 
 
 
192 aa  52  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  23.64 
 
 
175 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  30.77 
 
 
157 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  27.32 
 
 
149 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  27.42 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  30.5 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  32.52 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  27.34 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  26.29 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  28.16 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  28.1 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  32.41 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  30.09 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  26.85 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  28.1 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1880  PEBP family protein  27.84 
 
 
663 aa  48.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  30.33 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  29.69 
 
 
206 aa  47.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  28.16 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  26.96 
 
 
153 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  29.47 
 
 
199 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  29.41 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  27.01 
 
 
157 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  30.4 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  28.8 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  32.2 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  31.07 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  30.15 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  29.36 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  28.78 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  31.07 
 
 
207 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  25.51 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  30.28 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  28.7 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  30.28 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  24.31 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  26.85 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  30.28 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  27.27 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  26.32 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  28.57 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  30.25 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  24.41 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  25.66 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  27.93 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  30.28 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  29.2 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  27.35 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  30.68 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  28.21 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  27.35 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  28.3 
 
 
190 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>