More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2463 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2842  glutamate racemase  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.446044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2463  glutamate racemase  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.794821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  45.16 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  39.37 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  39.27 
 
 		 264 aa  165  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  37.23 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  39.44 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  37.22 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  36.24 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  35.18 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  42.33 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  39.19 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  35.61 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  40.74 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  41.28 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  40.83 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  40 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  37.67 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  30.97 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  39.53 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  40.37 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  38.99 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  37.61 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  39.04 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  39.17 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  34.91 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  39.91 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  36.11 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  40.28 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  36.36 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  34.74 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  37.89 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  38.25 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  36.53 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  37.85 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  38.72 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  40.83 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  37.5 
 
 		 288 aa  131  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  38.6 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  34.3 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  38.4 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  38.4 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  38.4 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  37.97 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  37.96 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  37.45 
 
 		 303 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  35.78 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  38.55 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  33.48 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  38.43 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  34.73 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  33.95 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  37.61 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  35.34 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  35.34 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  38.72 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  39.83 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  37.09 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  34.96 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  38.03 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  40.37 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  36.76 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  39.17 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  34.62 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  34.96 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  34.96 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  34.96 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  34.96 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  35.87 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  35.65 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  37.72 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  33.85 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  31.16 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33.82 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  35.65 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  32.86 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  32.88 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  30.66 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  37.79 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  28.77 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  33.33 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  33.94 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  31.52 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  33.8 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2156  glutamate racemase  33.18 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185114  normal  0.250573 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  31.4 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  33.02 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  33.33 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  37.1 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  32.88 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  31.68 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  33.95 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  33.49 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  33.33 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  31.46 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  31.37 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  32.17 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  32.72 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  33.33 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  33.33 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>