More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1257 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  100 
 
 		 256 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  44.31 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  45.08 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  44.53 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  44.66 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  41.02 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  41.06 
 
 		 295 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  42.11 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  41.7 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  43.5 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  41.87 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  42.34 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  40.65 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  42.11 
 
 		 263 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  41.06 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  44.08 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  41.7 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  44.08 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  44.44 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  41.06 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  44.08 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  44.08 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  40.65 
 
 		 290 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  43.55 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  41.37 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  45.97 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  44.49 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  41.53 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  41.94 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  41.8 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  40 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  42.13 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  42.19 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  44.08 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  44.08 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  40.65 
 
 		 290 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  40.65 
 
 		 290 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  40.65 
 
 		 290 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  40.65 
 
 		 290 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  42.29 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  39.34 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  43.15 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  44.49 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  42.75 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  45.21 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  45.75 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  43.67 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  40.85 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  40.68 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  38.28 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  41.11 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  44.69 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  44.78 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  37.94 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  36.08 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  36.19 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  40.08 
 
 		 263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  34.29 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  42.99 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  40.09 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  43.06 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  34.33 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  33.06 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  41.33 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  39.46 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2156  glutamate racemase  37.65 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185114  normal  0.250573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  40.64 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  33.07 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  32.68 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.2 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  33.33 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  32.26 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  33.03 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  32.4 
 
 		 276 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  35.22 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  34.8 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  33.08 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  32 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  31.5 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  34.84 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  31.85 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  34.43 
 
 		 295 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  33.62 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  34.48 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  33.62 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  33.05 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  33.33 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  31.1 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  38.05 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36.21 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  32.42 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  35.22 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  34.26 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  33.04 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  33.99 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  32.69 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  32.86 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  33.91 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  33.47 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  32.76 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>