More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1488 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  67.61 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  62.54 
 
 		 291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  59.65 
 
 		 296 aa  335  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  61.84 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  60.36 
 
 		 281 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  61.15 
 
 		 272 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  58.36 
 
 		 271 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  58.65 
 
 		 269 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  48.18 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  48.08 
 
 		 270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  46.69 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  46.91 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  47.01 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  46.82 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  46.46 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  46.85 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  47.01 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  47.55 
 
 		 282 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  49.37 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  44.37 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  47.37 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  47.18 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  45.06 
 
 		 254 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  47.41 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  48.74 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  48.74 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  48.32 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  46.91 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  45.96 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  43.83 
 
 		 263 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  46.39 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  48.32 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  48.32 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  48.32 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  48.32 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  44.3 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  48.1 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  48.52 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  48.1 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  48.1 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  48.1 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  44.68 
 
 		 265 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  44.68 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  44.26 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  44.4 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  44.66 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  42.36 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  36.92 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  47.23 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  42.69 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  40.39 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  39.65 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  36.4 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  36.4 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  41.95 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  40.48 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  36.86 
 
 		 259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  38.06 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  34.05 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  34.28 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  35.98 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  45.73 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  38.3 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  35.38 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  31.73 
 
 		 264 aa  146  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  39.07 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  41.7 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  35.4 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  38.27 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  32.58 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  35.27 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  37.71 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  45.99 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  37.77 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  38.3 
 
 		 275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  37.66 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  37.66 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  36.75 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33.93 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  33.33 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  37.93 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  32.86 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  38.96 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  36.36 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  38.98 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  37.87 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  38.75 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  33.76 
 
 		 258 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  37.24 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  30.86 
 
 		 271 aa  136  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  36.27 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  40.18 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  38.98 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>