More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2085 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  100 
 
 		 271 aa  534  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  49.1 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  50 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  45.74 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  44.96 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  46.31 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  46.26 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  46.36 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  45.7 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  45.63 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  46.12 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  43.7 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  43.3 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  46.7 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  45.14 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  44.75 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  49.34 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0284  glutamate racemase  47.74 
 
 		 340 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  42.46 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  43.97 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  40.74 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  44.49 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  43.19 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  44.92 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  43.31 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  42.57 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  41.22 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  40.08 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  36.36 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  42.75 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  43.12 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  36.86 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  43.02 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  37.96 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  38.65 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  36.26 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4709  glutamate racemase  39.08 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000583223  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  41.45 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  43.53 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  44.3 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  41.91 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  43.41 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  44.49 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  40.89 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  42.64 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  44.49 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  33.46 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  44.05 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  36.48 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  42.41 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  36.64 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  40.47 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  39.18 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  35.91 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  44.4 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  40.6 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  40.66 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  41.26 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000377093  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  44.05 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  44.05 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  44.05 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0180  glutamate racemase  40.81 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.815538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  41.8 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  44.05 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  36.73 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  43.97 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0174  glutamate racemase  40.81 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000222817  normal  0.0305567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  43.97 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  41.53 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  40.09 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  39 
 
 		 288 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  41.34 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.08 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0232  glutamate racemase  40.62 
 
 		 277 aa  158  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000508837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  41.04 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0181  glutamate racemase  40.43 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000024601  hitchhiker  0.0092557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0177  glutamate racemase  40.43 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000496539  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  42.28 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  39.83 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  37.55 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4177  glutamate racemase  40 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000486061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  41.08 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  39.84 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  33.46 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  37.96 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4075  glutamate racemase  40 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000696712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  34.75 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.89 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  34.75 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  36.84 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  42.2 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  37.44 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  37.86 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>