More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3832 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  100 
 
 
280 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  99.64 
 
 
280 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  99.64 
 
 
280 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  87.45 
 
 
278 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  86.99 
 
 
281 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  83.76 
 
 
271 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  76.26 
 
 
254 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  73.23 
 
 
264 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  69.47 
 
 
301 aa  348  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  65.9 
 
 
276 aa  322  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  62.64 
 
 
310 aa  321  7e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  61.34 
 
 
312 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  60.22 
 
 
360 aa  316  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  62.92 
 
 
293 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  67.06 
 
 
265 aa  315  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  66.93 
 
 
277 aa  313  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  62.96 
 
 
300 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  64.29 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  60.97 
 
 
282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  63.43 
 
 
282 aa  302  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  61.78 
 
 
270 aa  298  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  62.17 
 
 
268 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  59.09 
 
 
263 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  58.71 
 
 
268 aa  289  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  59.62 
 
 
277 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  60.38 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  57.14 
 
 
295 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  59.12 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  57.47 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  59.93 
 
 
268 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  62.69 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  40.75 
 
 
264 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  46.42 
 
 
272 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  38.29 
 
 
267 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  37.92 
 
 
269 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  37.92 
 
 
269 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  37.92 
 
 
269 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  37.92 
 
 
269 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  37.92 
 
 
269 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  37.92 
 
 
269 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  38.26 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  37.92 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  38.26 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  46.42 
 
 
272 aa  201  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  38.11 
 
 
267 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  44.7 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  44.61 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  45.66 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  41.67 
 
 
307 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  45.83 
 
 
266 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  44.15 
 
 
276 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  39.62 
 
 
264 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  41.79 
 
 
303 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  45.49 
 
 
281 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  41.89 
 
 
278 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  43.4 
 
 
278 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  42.29 
 
 
268 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.52 
 
 
270 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  43.07 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  42.75 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  43.14 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  36.53 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  38.31 
 
 
267 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  38.55 
 
 
271 aa  178  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  41.35 
 
 
267 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  35.66 
 
 
280 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  40.36 
 
 
283 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  40 
 
 
275 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  40.54 
 
 
276 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  40.54 
 
 
276 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  35.66 
 
 
280 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  40.54 
 
 
276 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  36.26 
 
 
264 aa  176  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  40.54 
 
 
276 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  36.76 
 
 
295 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  41.86 
 
 
265 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  35.41 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  43.98 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  41.51 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  41.51 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  40 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  39.08 
 
 
266 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  39.08 
 
 
266 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  40.7 
 
 
263 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  41.87 
 
 
263 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  41.76 
 
 
276 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  37.79 
 
 
271 aa  169  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  44.06 
 
 
259 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  44.06 
 
 
259 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  37.45 
 
 
264 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  43.02 
 
 
276 aa  168  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  39.45 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  43.5 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.23 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  37.25 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  40.71 
 
 
265 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  39.26 
 
 
282 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  41.86 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  42.99 
 
 
285 aa  161  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  40.62 
 
 
288 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>