More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3204 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  95.13 
 
 
267 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  95.09 
 
 
269 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  95.47 
 
 
269 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  95.47 
 
 
269 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  95.47 
 
 
269 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  95.09 
 
 
269 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  95.47 
 
 
269 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  95.47 
 
 
269 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  95.47 
 
 
269 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  94.34 
 
 
269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  72.73 
 
 
264 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  65.91 
 
 
264 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  52.65 
 
 
264 aa  275  8e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  49.43 
 
 
271 aa  272  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  48.5 
 
 
271 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  52.47 
 
 
275 aa  261  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  51.71 
 
 
275 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  50.75 
 
 
276 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  52.65 
 
 
267 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  50.75 
 
 
276 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  50.75 
 
 
276 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  50.75 
 
 
276 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  51.5 
 
 
266 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  51.5 
 
 
266 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  48.3 
 
 
281 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  47.53 
 
 
288 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  46.79 
 
 
276 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  46.79 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  44.11 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  46.24 
 
 
291 aa  238  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  47.33 
 
 
278 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  44.49 
 
 
275 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  44.92 
 
 
277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  45.08 
 
 
266 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  42.21 
 
 
267 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  41.7 
 
 
303 aa  228  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.97 
 
 
270 aa  227  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  41.99 
 
 
307 aa  227  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  46.18 
 
 
278 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  43.6 
 
 
264 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  45.53 
 
 
276 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  41.67 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  44.83 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  45.31 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  44.49 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  44.7 
 
 
272 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  44.58 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  43.23 
 
 
270 aa  217  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  43.77 
 
 
285 aa  216  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  43.28 
 
 
310 aa  216  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  42.48 
 
 
312 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  39.1 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  43.19 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  40.98 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.86 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  42.48 
 
 
360 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  42.48 
 
 
259 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  42.48 
 
 
259 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  39.31 
 
 
275 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  39.31 
 
 
275 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  44.62 
 
 
276 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  42.86 
 
 
282 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  41.35 
 
 
259 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  43.08 
 
 
300 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  42 
 
 
282 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  41.73 
 
 
268 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  44.78 
 
 
268 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  38.49 
 
 
280 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  38.49 
 
 
280 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  44.74 
 
 
268 aa  204  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  44.11 
 
 
270 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  40.15 
 
 
281 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  39.19 
 
 
278 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  40.38 
 
 
276 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  42.48 
 
 
281 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  39.77 
 
 
271 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  42.08 
 
 
263 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  39.92 
 
 
264 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  39.76 
 
 
254 aa  201  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  40.46 
 
 
258 aa  201  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  38.11 
 
 
280 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  42.32 
 
 
292 aa  201  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  40 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  37.78 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  39.25 
 
 
280 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  37.12 
 
 
283 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  42.91 
 
 
285 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  37.45 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  37.55 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  38.72 
 
 
273 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  38.87 
 
 
280 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  39.31 
 
 
267 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.16 
 
 
289 aa  189  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  40.46 
 
 
268 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  42.17 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  40.23 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  39.85 
 
 
269 aa  188  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  34.47 
 
 
267 aa  188  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  37.01 
 
 
270 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>