More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1403 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  65.75 
 
 
264 aa  355  5e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  60.52 
 
 
271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  52.19 
 
 
264 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  49.62 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  49.62 
 
 
269 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  49.62 
 
 
269 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  49.62 
 
 
269 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  49.62 
 
 
269 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  49.43 
 
 
267 aa  272  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  49.62 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  49.62 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  49.24 
 
 
269 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  49.24 
 
 
269 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  49.24 
 
 
267 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  50.79 
 
 
264 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  44.74 
 
 
291 aa  239  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  43.28 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  46.77 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  43.02 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  48.59 
 
 
276 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  48.59 
 
 
276 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  48.59 
 
 
276 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.38 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  40.94 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  47.39 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  47.79 
 
 
276 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  47.39 
 
 
275 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  43.31 
 
 
267 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  43.31 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  43.31 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  42.52 
 
 
267 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  42.63 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  40.78 
 
 
292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  39.84 
 
 
276 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  42.01 
 
 
303 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  38.98 
 
 
272 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  40.55 
 
 
278 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  40.87 
 
 
281 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  39.04 
 
 
288 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  37.5 
 
 
267 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  39.43 
 
 
281 aa  202  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  39.53 
 
 
278 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  38.67 
 
 
275 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  41.15 
 
 
295 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  39.53 
 
 
281 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  38.58 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  39.62 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  40.91 
 
 
277 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  44.44 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  40.22 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  49.28 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  42.18 
 
 
270 aa  198  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  39.13 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  43.38 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  39.69 
 
 
270 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  45.67 
 
 
278 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  38.49 
 
 
275 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  38.49 
 
 
275 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  41.26 
 
 
264 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  37.94 
 
 
284 aa  195  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  36.29 
 
 
295 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  36.54 
 
 
273 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  42.8 
 
 
268 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  42.13 
 
 
272 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  40.48 
 
 
265 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  38.1 
 
 
265 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  37.22 
 
 
266 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  39.55 
 
 
267 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  41.57 
 
 
285 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  37.85 
 
 
289 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  38.67 
 
 
282 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  37.69 
 
 
360 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  38.06 
 
 
312 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  39.62 
 
 
259 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  37.85 
 
 
265 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  38.1 
 
 
282 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  39.76 
 
 
276 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  44.98 
 
 
267 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  38.25 
 
 
271 aa  186  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  39.62 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  39.62 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  46.41 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  44.98 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  40 
 
 
300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  39.61 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  39.61 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  39.06 
 
 
278 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  37.8 
 
 
269 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  36.47 
 
 
283 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  38.93 
 
 
280 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  36.82 
 
 
276 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  37.45 
 
 
310 aa  182  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  38.93 
 
 
280 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  45.45 
 
 
273 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  38.28 
 
 
281 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  38.58 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  44.98 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  36.36 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  39.69 
 
 
281 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>