More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5525 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  100 
 
 		 286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  92.65 
 
 		 285 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  92.28 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  92.28 
 
 		 285 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  92.28 
 
 		 285 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  89.96 
 
 		 287 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  77.49 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  76.6 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  76.6 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  76.23 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  76.23 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  76.23 
 
 		 290 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  76.23 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  76.23 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  72.96 
 
 		 288 aa  390  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  69.2 
 
 		 303 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  66.2 
 
 		 295 aa  361  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  67.63 
 
 		 284 aa  361  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  59 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  58.62 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  57.47 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  57.41 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  56.49 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  53.08 
 
 		 263 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  48.66 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  52.33 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  52.61 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  47.71 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  47.35 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  51.32 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  50.88 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  47.71 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  47.71 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  50 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  50 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  52.56 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  46.59 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  48.68 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  45.45 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  44.49 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  44.84 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  48.72 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  45.37 
 
 		 266 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  42.21 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  47.04 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  46.3 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  47.93 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  41.39 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  47.71 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  48.12 
 
 		 291 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  48.2 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  44.7 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  50.24 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  49.16 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  47.84 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  44.16 
 
 		 281 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  41.91 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  45.36 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  51.14 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  39.11 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  45 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  38.31 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  44.87 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  41 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  45.45 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  39.63 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  40.66 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  45.5 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  40.62 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  35.66 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  39.93 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  42.86 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  40.16 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  40.32 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  39.3 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  41.86 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  37 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  35.23 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  42.53 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  41.51 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34.26 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  38.67 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  39.57 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  40.7 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  40.7 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  39.61 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  39.92 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  40.54 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  39.77 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  38.22 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.54 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  39.77 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  34.07 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  39.06 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  37.16 
 
 		 360 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  41.94 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  34.5 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  37.36 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  34.93 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  37.01 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>