More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0590 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  67.79 
 
 		 301 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  68.48 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  64.98 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  63.1 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  68.24 
 
 		 282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  64.29 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  66.4 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  63.43 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  63.22 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  62.92 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  63.3 
 
 		 280 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  63.3 
 
 		 280 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  63.02 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  62.55 
 
 		 282 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  63.81 
 
 		 277 aa  316  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  64.45 
 
 		 278 aa  316  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  62.92 
 
 		 280 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  61.11 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  64.23 
 
 		 281 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  62.78 
 
 		 300 aa  310  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  60.77 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  56.66 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  59.57 
 
 		 277 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  61.85 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  61.22 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  60.94 
 
 		 254 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  66.92 
 
 		 292 aa  298  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  62.06 
 
 		 265 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  62.55 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  60.22 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  42.75 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  42.46 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  41.22 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  42.46 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  41.7 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  41.7 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  41.7 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  41.7 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  41.7 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  44.44 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  41.7 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  41.31 
 
 		 269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  46.83 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  40.98 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  45.15 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  46.82 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  48.05 
 
 		 272 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  42.41 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  47.08 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  47.47 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  42.55 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  41.97 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  44.36 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  43.53 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  45.85 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  42.26 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  45.53 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.92 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  45.74 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  43.12 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  43.19 
 
 		 264 aa  192  8e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  43.48 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  42.05 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  41.79 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  41.79 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  37.11 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  43.68 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  38.25 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  43.94 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  38.13 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  45.06 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  45.45 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  44.75 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  41.48 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  41.48 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.08 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  45.21 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  45.21 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  40.32 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  39.92 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  40.32 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  40.32 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  39.92 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  35.77 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  39.18 
 
 		 265 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  40.98 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  39.84 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  37.89 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  39.53 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  42.05 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  40.15 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  36.74 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  40.67 
 
 		 263 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  40.38 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  40.47 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  39.47 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  37.5 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  37.74 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  39.39 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>