More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3247 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  48.99 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  50.64 
 
 		 270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  46.89 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  47.77 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  46.18 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  50 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  38.76 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  47.2 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  46.72 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  45.97 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  48.86 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  49.08 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  44.26 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  44.22 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  44.22 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  43.85 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  48.79 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  47.95 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  44.13 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  43.46 
 
 		 290 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  43.46 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  44.13 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  43.78 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  48.62 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  44.8 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  43.08 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  43.08 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  42.26 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  43.08 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  43.08 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  44.95 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  42.51 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  46.05 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  42.42 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  36.47 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  42.62 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  47.87 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  42.74 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  42.91 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  41.37 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  37.19 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  42.53 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  37.19 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  40.86 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  36.9 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  36.78 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  39.83 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  45.54 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  45.54 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  45.09 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  45.1 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  38.25 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  38.49 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.16 
 
 		 281 aa  168  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  39.45 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  40.38 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  40.38 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  38.58 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  39.38 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  38.58 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  41.34 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  42.39 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  41.38 
 
 		 286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  40 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  39.23 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  44.7 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  39.68 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  38.07 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  38.89 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  39.92 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  38.75 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  40.08 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  38.77 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  37.4 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  35.34 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  35.34 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  38.49 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  37.56 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  37.33 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  38.12 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  37.04 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  40.41 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  41.77 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  37.56 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  33.06 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  38.35 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  36 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  35.66 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  38.82 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  40.77 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33.73 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  34.7 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>