More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0733 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  86.84 
 
 		 266 aa  490  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  86.84 
 
 		 266 aa  490  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  53.1 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  52.09 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  52.09 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  52.09 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  52.09 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  52.09 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  52.09 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  51.7 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  53.15 
 
 		 264 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  51.71 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  51.71 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  51.71 
 
 		 269 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  52.65 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  45.28 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  48.1 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  47.84 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  47.69 
 
 		 275 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  47.27 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  43.31 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  46.92 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  47.45 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  47.45 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  47.26 
 
 		 276 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  40.6 
 
 		 271 aa  215  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  40.36 
 
 		 303 aa  214  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  46.41 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  41.51 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  43.08 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.38 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  41.85 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.97 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  40.73 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  40.62 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  42.48 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  39.25 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  43.88 
 
 		 278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  41.22 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  44.3 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  38.26 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  43.1 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  39.69 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  40.16 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  37.64 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  42.63 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  36.67 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  41.96 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  38.58 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  35.29 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  40.77 
 
 		 360 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  38.26 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  40.08 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  41.11 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  39.85 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  39.45 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  39.45 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  38.2 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  40.52 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  39.62 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  48.66 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.67 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  38.74 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  40.68 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  39.45 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  39.84 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  39.92 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  39.68 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  37.01 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  37.01 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  41.18 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  37.89 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  40.08 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  42.01 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  38.67 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  40.61 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  37.85 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  36.69 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  38.46 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  38.28 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  39.37 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  35.23 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  44.62 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  36.94 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  45.16 
 
 		 284 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  38.59 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  35.69 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  36.54 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  37.92 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  36.9 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  39.85 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  40.18 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  38.3 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  34.6 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  34.96 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  37.69 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  38.01 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  38.8 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  38.55 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>