More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2867 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  98.97 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  69.66 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  62.54 
 
 		 296 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  58.36 
 
 		 301 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  57.71 
 
 		 281 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  55.76 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  54.68 
 
 		 271 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  50 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  44.13 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  46.18 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  46.51 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  48.12 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  47.11 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  42.96 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  47.84 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  45.09 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  49.08 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  46.28 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  44.49 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  49.18 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  49.18 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  47.62 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  48.77 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  48.53 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  48.53 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  45.34 
 
 		 263 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  48.77 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  48.77 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  48.77 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  48.77 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  46.01 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  46.93 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  45.49 
 
 		 265 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  46.93 
 
 		 287 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  46.43 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  44.69 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  41.75 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  47.11 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  49.57 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  45.76 
 
 		 265 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  47.3 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  43.8 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  45.45 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  46.89 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  47.46 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  47.74 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  47.39 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  45.34 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  40.51 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  43.53 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  40.38 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  44.58 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  37.41 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  43.04 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  40.25 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  32.5 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  34.07 
 
 		 266 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  37.78 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  36.93 
 
 		 260 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  35.93 
 
 		 259 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  35.19 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  41.76 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  36.43 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  36.78 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  42.81 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  36.96 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.97 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  32.07 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  41.03 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  36.75 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  35.19 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  37.25 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  35.56 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  34.88 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0284  glutamate racemase  34.6 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  32.87 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  32.87 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33.56 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  37.08 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  31.02 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  36.36 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  32.26 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2884  glutamate racemase  31.95 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00254237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2156  glutamate racemase  37.77 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185114  normal  0.250573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  37.34 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  38.26 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  32.02 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  29.93 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  29.89 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  36.33 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  35.54 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>