More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1214 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  45.83 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  45.28 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  45.83 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  42.34 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  43.23 
 
 		 272 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  41.54 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  42.14 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  44.07 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  42.13 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  40.55 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  41.09 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  46.33 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  39.33 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  42.91 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  37.5 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  38.95 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  44.53 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  40.16 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  40.94 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  44.15 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  40.08 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.45 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  42.86 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  42.86 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  42.69 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  42.48 
 
 		 259 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  39.22 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  37.08 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  41.84 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  40.38 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  36.4 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  36.4 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  45.15 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  43.48 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  39.3 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  37.69 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  39.53 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  39.92 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  39.53 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  36.7 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  42.48 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  35.96 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  39.13 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  41.04 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.7 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  36.7 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  40.99 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  39.46 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  34.46 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  42.01 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  44.29 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  41.67 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  35.96 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  35.96 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  35.56 
 
 		 289 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  43.95 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  37.5 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  41.27 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  41.27 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  43.95 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  41.27 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  38.57 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  41.27 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  37.67 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  41.86 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  40.37 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.43 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  38.46 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  35.38 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  36.84 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  36.77 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  37.85 
 
 		 280 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  39.46 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  36.88 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  40.47 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  40.23 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  37.3 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  36.33 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  34.32 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  36.22 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  36.25 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  37.61 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  39.19 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  34.32 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  34.73 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  35.25 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  37.5 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  36.72 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  33.85 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  36.64 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  36.44 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  39.91 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>