More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0664 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  100 
 
 
259 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  94.98 
 
 
259 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  94.98 
 
 
259 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  85.33 
 
 
259 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  60.56 
 
 
276 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  59.76 
 
 
272 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  57.37 
 
 
278 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  58.57 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  56.57 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  56.87 
 
 
278 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  56.57 
 
 
288 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  54.2 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  43.68 
 
 
267 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  50.76 
 
 
267 aa  242  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  46.39 
 
 
261 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  47.56 
 
 
260 aa  234  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  51.52 
 
 
272 aa  232  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  43.94 
 
 
270 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  50.92 
 
 
308 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  49.24 
 
 
265 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  48.12 
 
 
269 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  49.45 
 
 
282 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  50.19 
 
 
272 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  46.77 
 
 
275 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  46.77 
 
 
275 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  48.68 
 
 
271 aa  225  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  42.75 
 
 
268 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  50 
 
 
276 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  43.08 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  42.91 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  42.69 
 
 
280 aa  218  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  46.07 
 
 
274 aa  216  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  49.82 
 
 
285 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  46.39 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  45.66 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  43.51 
 
 
264 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  55.66 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  41.18 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  45.82 
 
 
311 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  56.98 
 
 
268 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  44.36 
 
 
269 aa  208  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  47.91 
 
 
268 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  41.35 
 
 
267 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  42.66 
 
 
291 aa  205  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  40.6 
 
 
267 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  40.32 
 
 
259 aa  202  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  40.46 
 
 
269 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  40.46 
 
 
269 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  40.46 
 
 
269 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  40.46 
 
 
269 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  40.46 
 
 
269 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  40.46 
 
 
269 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  40.77 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  40.77 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  41.3 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  40.08 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  43.85 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  45.42 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  40.61 
 
 
267 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  42.48 
 
 
268 aa  191  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  46.48 
 
 
285 aa  189  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  47.55 
 
 
268 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  40.86 
 
 
307 aa  189  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  39.62 
 
 
271 aa  188  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  37.11 
 
 
264 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  40.23 
 
 
266 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  40.23 
 
 
266 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  42.31 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  45.45 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  44.11 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  43.73 
 
 
279 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  42.46 
 
 
276 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  40.31 
 
 
284 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  45.53 
 
 
301 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  43.02 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  40.77 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  40.55 
 
 
292 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.8 
 
 
289 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  47.55 
 
 
285 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  43.98 
 
 
278 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  38.02 
 
 
271 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  45 
 
 
281 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  37.89 
 
 
267 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  38.7 
 
 
295 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  45.14 
 
 
271 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  44.36 
 
 
280 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  44.36 
 
 
280 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  44.92 
 
 
277 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  41.96 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  39.53 
 
 
281 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  43.02 
 
 
310 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  35.25 
 
 
283 aa  176  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  37.87 
 
 
274 aa  175  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  41.44 
 
 
276 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  45.14 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  43.85 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  38.89 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  41.44 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  41.44 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  44.88 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>