More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0346 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  75.19 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  73.33 
 
 		 273 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  75.38 
 
 		 267 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  71.7 
 
 		 269 aa  391  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  70.37 
 
 		 271 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  69.96 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  50.56 
 
 		 275 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  50.56 
 
 		 275 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  48.3 
 
 		 266 aa  259  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  50.19 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  48.11 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  47.66 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  49.25 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  46.54 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  47.27 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  44.66 
 
 		 267 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  46.48 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  45.98 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  45.17 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  44.32 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  44.24 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  43.94 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  44.49 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  42.54 
 
 		 276 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  46.07 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.59 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  45.28 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  45.28 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  43.43 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  40.75 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  44.05 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  45.86 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  47.96 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  44.09 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  41.91 
 
 		 285 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  44.27 
 
 		 292 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  39.31 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  42.25 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  38.87 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  38.93 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  40.65 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  40.86 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  41.06 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  41.25 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  43.13 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  38.67 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.68 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  40 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  39.61 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.7 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  39.53 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  42.21 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  38.78 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  42.98 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  40.68 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  38.08 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  37.74 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  37.74 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  41.77 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  39.22 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  37.74 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  37.74 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  37.74 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  37.5 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  37.74 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  38.31 
 
 		 307 aa  181  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  35.96 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  37.35 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  37.35 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  37.16 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  37.35 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  37.35 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  44.98 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  44.69 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  41.96 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  38.49 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  41.83 
 
 		 284 aa  175  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  43.07 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  37.45 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  37.09 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  39.45 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  39.02 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  39.7 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  36.33 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  40.32 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  38.7 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  39.77 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  38.46 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  38.46 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  38.85 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  38.3 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  38.41 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  36.82 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  42.49 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  39.06 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  37.45 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  37.6 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  42.86 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  37.61 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>