More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3460 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  64.31 
 
 		 269 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0473  hypothetical protein  48.05 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  38.66 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  38.43 
 
 		 264 aa  195  8.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  37.8 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  38.46 
 
 		 269 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  39.23 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  39.23 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  38.46 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  37.8 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  37.01 
 
 		 275 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  36.02 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  37.85 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  37.01 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  37.45 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  37.5 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  37.02 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  38.76 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  36.78 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  35.69 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  37.21 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  36.15 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  38.58 
 
 		 272 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  33.21 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  36.33 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  36.9 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  36.08 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.98 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  34.13 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  34.24 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  33.59 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  34.62 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  36.33 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  32.55 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  35.14 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  31.95 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  32.58 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  33.7 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  34.08 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  35.25 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  31.7 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  32.71 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  35.19 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  33.33 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  31.79 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  33.46 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  33.07 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  32.32 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  33.75 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  32.48 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  32.95 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  33.08 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  33.08 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  34.6 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  33.06 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  31.32 
 
 		 308 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  34.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  38.71 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  37.27 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  33.89 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  33.72 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  34.11 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  32.17 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  32.69 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  36.65 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  32.84 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  34.23 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  30.59 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  30.59 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  30.59 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  32.58 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  30.2 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  30.2 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  33.33 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  30.59 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  30.2 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  30.2 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  30.2 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  33.46 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  30.2 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  31.97 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  34.41 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  35.96 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  33.46 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  33.59 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  30.53 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  31.32 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4218  glutamate racemase  30.47 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  29.8 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  29.43 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  33.33 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  31.7 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  30.15 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  33.98 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  33.85 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  32.94 
 
 		 284 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  33.72 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  32.82 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  32.68 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>