More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0538 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  46.39 
 
 
259 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  45.91 
 
 
267 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  46.01 
 
 
259 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  46.01 
 
 
259 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  43.7 
 
 
268 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  45.06 
 
 
275 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  45.06 
 
 
275 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  43.08 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  44.66 
 
 
265 aa  220  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  45.28 
 
 
267 aa  219  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  46.06 
 
 
276 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  44.81 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  46.12 
 
 
272 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  44.49 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  44.87 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  44.08 
 
 
275 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  44.81 
 
 
288 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  44.15 
 
 
266 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  45.64 
 
 
278 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  44.53 
 
 
268 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  45.28 
 
 
271 aa  208  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  46.06 
 
 
278 aa  205  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  44.66 
 
 
272 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  44.22 
 
 
269 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  44.09 
 
 
273 aa  202  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  43.87 
 
 
258 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  42.8 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  44.09 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  42.75 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  41.03 
 
 
282 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  40.52 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  39.92 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  40.7 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  39 
 
 
311 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  41.06 
 
 
276 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  38.69 
 
 
280 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  41.77 
 
 
277 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  44.86 
 
 
264 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  39.78 
 
 
308 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  41.22 
 
 
268 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  38.31 
 
 
260 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  41.02 
 
 
285 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  37.74 
 
 
295 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  38.46 
 
 
271 aa  184  9e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  41.44 
 
 
312 aa  184  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  44.76 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  45.33 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  35.82 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  38.55 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  36.12 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  42.47 
 
 
268 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  36.12 
 
 
280 aa  182  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  40 
 
 
270 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  42.52 
 
 
291 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  42.52 
 
 
265 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  37.02 
 
 
269 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  37.97 
 
 
289 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  38.49 
 
 
270 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  36.19 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  41.47 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  38.87 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  36.4 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  40.98 
 
 
293 aa  178  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  38.11 
 
 
284 aa  178  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  41.86 
 
 
271 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  41.1 
 
 
264 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  40.32 
 
 
276 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  35 
 
 
264 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  39.08 
 
 
267 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  35.19 
 
 
274 aa  176  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  43.33 
 
 
270 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  40.15 
 
 
360 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  38.7 
 
 
267 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  45.24 
 
 
277 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  38.93 
 
 
276 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  40.41 
 
 
269 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  38.85 
 
 
282 aa  175  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  40.86 
 
 
285 aa  174  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  40 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  36.65 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  41.42 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.16 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  38.91 
 
 
295 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  36.64 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  36.36 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  39.13 
 
 
300 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4218  glutamate racemase  35.94 
 
 
285 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  44.26 
 
 
268 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  41.12 
 
 
276 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  39.69 
 
 
310 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  42.25 
 
 
268 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  41.9 
 
 
271 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>