More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0705 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  56.09 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  55.88 
 
 		 279 aa  331  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  54.21 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4218  glutamate racemase  44.48 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1122  glutamate racemase  39.13 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.742297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1760  glutamate racemase  39.05 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3973  glutamate racemase  38.04 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0897  glutamate racemase  36.59 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0195405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2947  glutamate racemase  36.96 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1593  glutamate racemase  36.96 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0287859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  36.63 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2338  glutamate racemase  37.77 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.34847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  36.1 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  38.97 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  38.97 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  37.07 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  37.45 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  36.54 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  35.19 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  36.33 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  35.9 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  35.47 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  37.87 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  37.45 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  36.92 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  32.84 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  37.07 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  33.33 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  34.46 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  36.15 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  36.59 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  34.69 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  35.51 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  36.76 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  37.07 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.71 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  39.33 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  35.14 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  38.32 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  35.14 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  32.26 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  34.7 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  34.78 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  32 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  34.7 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  31.95 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  31.17 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  32.31 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33.09 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  33.97 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  34.3 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  32.84 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  33.33 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  34.08 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  32.21 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  35.84 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  34.35 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  33.95 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  31.97 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  34.39 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  33.21 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  32.95 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  33.71 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4875  glutamate racemase  35.27 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  34.2 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  30.94 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  31.34 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  34.46 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  33.96 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  36 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  33.82 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  33.85 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  30.91 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  33.21 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  33.45 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  34.18 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  33.21 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  32.56 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  32.27 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  32.72 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  34.83 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  35.91 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  34.7 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  32.22 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  35.34 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  35.21 
 
 		 284 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  33.21 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  32.82 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  34.56 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  29.63 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  33.09 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  32.95 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>