More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4875 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4875  glutamate racemase  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2338  glutamate racemase  42.4 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.34847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3973  glutamate racemase  42.4 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1760  glutamate racemase  40.07 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2947  glutamate racemase  41.34 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1593  glutamate racemase  41.34 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0287859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0897  glutamate racemase  41.7 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0195405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1122  glutamate racemase  38.87 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.742297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  40.43 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  37.46 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4218  glutamate racemase  38.52 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  35.27 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  35 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  33.33 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  33.21 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  33.33 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  33.93 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  33.93 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  33.93 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  33.93 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  33.57 
 
 		 269 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  33.57 
 
 		 269 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  33.21 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33.57 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  37.23 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  30.14 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  35.13 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  34 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  30.71 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  33.9 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  34.6 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  34.32 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  33.33 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  33.2 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  33.87 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  32.67 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  29.89 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  36 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  32.13 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  34.65 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  33.93 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  30.11 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  32.27 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  27.41 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  31.47 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  30.71 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  33.47 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  37.17 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  32.28 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  31.29 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  31.69 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  32.85 
 
 		 254 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  30.94 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  30.53 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  32.16 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  31.43 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  31.23 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  31.7 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  31.91 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  31.44 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  35.54 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  32.38 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  30.2 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  32.22 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  32.98 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  32.97 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  31.23 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  31.23 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  31.64 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  34.42 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  33.05 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  30.11 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  29.72 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  33.33 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  30.96 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  31.9 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  31.32 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  31.14 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  30.47 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  30.58 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  28.98 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  31.25 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  28.88 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  33.57 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  33.57 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0061  glutamate racemase  25.52 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.21676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  32.97 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  30.82 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  27.24 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  28.93 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  27.84 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  29.54 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  30.8 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  31.82 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  28.83 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  30.22 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  32.62 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  30.22 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  27.37 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  33.33 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>