More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4214 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  49.8 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  52.05 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  54.27 
 
 		 270 aa  248  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  47.81 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  52.23 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  49.8 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  51.42 
 
 		 265 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  51.01 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  53.16 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  50 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  49.8 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  49.59 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  48.76 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  44.22 
 
 		 270 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  48.45 
 
 		 272 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  48.99 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  49.79 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  49.77 
 
 		 282 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  46.61 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  48.18 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  44.13 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  48.35 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  46.19 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  43.95 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  47.52 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  41 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  41 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  44.44 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  45.11 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  45.64 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  49.12 
 
 		 290 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  43.27 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  49.12 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  49.12 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  46.06 
 
 		 295 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  41.84 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  45.45 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  46.89 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  44.76 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  46.31 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  39.92 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  48.67 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  48.67 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  48.67 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  48.67 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  47.95 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  47.75 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  43.88 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  44.7 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  41.13 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  41.37 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  43.95 
 
 		 278 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  43.38 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  41.13 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  46.56 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  43.2 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  44.3 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  38.25 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  45.99 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  40.82 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  45.99 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  47.75 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  47.75 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  47.75 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  42.74 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  38.78 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  47.76 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  41.67 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  39.23 
 
 		 295 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  40.16 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  35.48 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  44.23 
 
 		 281 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  38.65 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  42.45 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  46.05 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  37.8 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  41.41 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  37.08 
 
 		 270 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  36.03 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.26 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  44.92 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  38.25 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  48.2 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  39.59 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  39.37 
 
 		 282 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  36.59 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  38.31 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  36.21 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  37.4 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>