More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1992 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  63.2 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  52.45 
 
 		 253 aa  256  4e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  44.4 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  48.56 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  45.78 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  44.44 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  43.12 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  44.44 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  39.77 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  39.52 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  40 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  38.75 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  38.59 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  36.97 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  36 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  36.69 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2463  glutamate racemase  36.77 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.794821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2842  glutamate racemase  36.77 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.446044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  37.08 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  37.5 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  31.2 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  36.36 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  40 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  41.26 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  36.12 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  36.67 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  35 
 
 		 259 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  38.91 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  38.33 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  36.15 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  34.07 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  35.14 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  35.86 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  33.47 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  32.08 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  36.32 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  33.47 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  39.49 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  33.47 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  32.75 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  32.21 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  36.76 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  35.17 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33.64 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  34.43 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  37.31 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  35.25 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  34.3 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  35.25 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  32.3 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  34.58 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  31.58 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  29.96 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  37.69 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  33.61 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  33.73 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  36.33 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  34.84 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  31.58 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  29.92 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  34.11 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  29.92 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  29.58 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  35.65 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2156  glutamate racemase  36.09 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185114  normal  0.250573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  33.06 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  29.8 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  31.88 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  36.36 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  36.84 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  30.87 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  32.92 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  29.51 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  33.59 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  30.97 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  28.46 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  32.66 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  30.4 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  38.5 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  30.89 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  35.65 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  31.3 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  33.2 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  32.51 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0181  glutamate racemase  32.68 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000024601  hitchhiker  0.0092557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  34.93 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  29.81 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0177  glutamate racemase  32.3 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000496539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  28.69 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  36.56 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  34.84 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>