More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3402 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  56.68 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  44.4 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  44.22 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  45.3 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  41.7 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  44.07 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  44.39 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  40 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  41.43 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  40.17 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  40.87 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  34.78 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  40.72 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  35.47 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  36.48 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  38.12 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  36.6 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  35.41 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  39.08 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  38.96 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  37.18 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  36.13 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  39.13 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  31.49 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  32.07 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  31.65 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  37.84 
 
 		 277 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  35.86 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  34.33 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  35.86 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  31.22 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  31.22 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  39.32 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  33.47 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  34.22 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  35.62 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  35.34 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  34.22 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  33.79 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  36.14 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  35.04 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34.1 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  35.02 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  38.33 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  35.04 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  31.72 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  35.19 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  32.47 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  36.04 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  35.43 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  34.87 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  33.76 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  32.77 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  30.21 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  35.27 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  35.55 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  37.23 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  32.39 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  33.05 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  33.64 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  30.59 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  35.62 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  35.82 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  34.65 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  34.48 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  35.11 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  34.51 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  39.56 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  34.6 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  33.76 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  35.18 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  32.78 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  33.76 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  32.2 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  34.51 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  34.67 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  31.78 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  33.47 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  32.77 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  30.26 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  37.5 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  33.76 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  34.76 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  34.76 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  32.35 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  33.18 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  30.42 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  30.8 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  30.74 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  35.16 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  32.49 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  32.2 
 
 		 284 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>