More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1140 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  79.03 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  51.41 
 
 		 280 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  51.81 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  50.6 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  49.81 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  48.28 
 
 		 290 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  48.28 
 
 		 290 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  48.28 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  47.69 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  46.33 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  47.49 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  48.46 
 
 		 288 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  47.89 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  47.89 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  47.89 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  47.89 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  47.89 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  48.26 
 
 		 303 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  48.46 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  48.47 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  48.46 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  48.46 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  48.45 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  50 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  48.66 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  43.95 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  45.8 
 
 		 282 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  47.21 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  48.61 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  49.07 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  43.43 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  45.53 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  50.23 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  45.11 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  44.26 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  42.13 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  43.39 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  46.76 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  44.21 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  43.8 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  40.86 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  43.39 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  41.9 
 
 		 288 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  38.89 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  39.84 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  47.85 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  39.44 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  41.44 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  44.17 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  44.91 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  41.09 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  46.76 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  40.74 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  42.8 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  45.53 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  45.73 
 
 		 301 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  39.13 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  40.65 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  37.9 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  44 
 
 		 296 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  34.77 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  38 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  45.58 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  38.95 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34.59 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  42.39 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  37.15 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  37.15 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  43.53 
 
 		 291 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  41.18 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  42.52 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  40.35 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  43.69 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  41.23 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  37.72 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  34.52 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  38.68 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  41.8 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  40.69 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  37.28 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  34.78 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  39.52 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  39.52 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  38.57 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  39.05 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  34.88 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  39.52 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  35.89 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  35.57 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  39.05 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.25 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  39.05 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  39.05 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  39.05 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  39.05 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  33.33 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  38.53 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  38.57 
 
 		 269 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.92 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>