More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2893 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  96.92 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  46.72 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  45.63 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  43.72 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  44.84 
 
 		 263 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  45.58 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  41.04 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  42.28 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  44.39 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  43.19 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  41.87 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  39.84 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  39.29 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  44.22 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  43.4 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  41 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  43.53 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  44.87 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  44.05 
 
 		 282 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  38.19 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  42.69 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  44.05 
 
 		 280 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  43.55 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  42.46 
 
 		 287 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  43.93 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  43.93 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  43.93 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  43.5 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  38.89 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  43.75 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  42 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  43.16 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  40.7 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  42.41 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  42.21 
 
 		 286 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  37.15 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2842  glutamate racemase  44.91 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.446044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2463  glutamate racemase  44.91 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.794821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  39.44 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  38.58 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  43.04 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  38.84 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  44.44 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  37.15 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  41.15 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  39.02 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  46.58 
 
 		 277 aa  184  9e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  43.38 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  39.02 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  39.02 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  44.34 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  38.62 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  38.62 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  38.62 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  38.62 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  35.43 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  38.91 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  39.13 
 
 		 330 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  37.96 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  36.4 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  37.55 
 
 		 333 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  37.86 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  40 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  34.78 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  37.01 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  33.86 
 
 		 285 aa  174  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  39.56 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  32.67 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  37.19 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  35.32 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  33.2 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  34.56 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  33.47 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  37.97 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  40.36 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  35.9 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0284  glutamate racemase  37.29 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  40.65 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  33.33 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  38.72 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  33.93 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.72 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  36.48 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  33.47 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  31.4 
 
 		 273 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  34.67 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  35.5 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  34.84 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  34.67 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  36.32 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  38.5 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  36.32 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33.6 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  36.32 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  33.48 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  32.68 
 
 		 295 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  35.78 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  34.5 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  36 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>