More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0284 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0284  glutamate racemase  100 
 
 		 340 aa  693    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  66.52 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  65.61 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  47.35 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  37.29 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  37.5 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  39.01 
 
 		 263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  42.73 
 
 		 272 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  39.13 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  35.34 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  37.83 
 
 		 270 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  36.73 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  37.21 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  41.36 
 
 		 254 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  39.57 
 
 		 270 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  39.66 
 
 		 265 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  39.47 
 
 		 263 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  39.91 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  37.29 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  36.48 
 
 		 275 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  41.07 
 
 		 272 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  36.88 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  35.34 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  38.01 
 
 		 264 aa  150  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  37.55 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  36.63 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  39.18 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  37.55 
 
 		 265 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  37.45 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  35.92 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  37.39 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  38.46 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  37.66 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  37.61 
 
 		 290 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  35.66 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  34.69 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  37.66 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  37.66 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  39.11 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  37.93 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  34.47 
 
 		 273 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.9 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  38.24 
 
 		 287 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  35.99 
 
 		 289 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  37.78 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  36.13 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  37.55 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  37.23 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  37.23 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  37.23 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  36.13 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  37.23 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  38.24 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  35.71 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  37 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  37.99 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  37.99 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  36.17 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  41.45 
 
 		 268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  37.99 
 
 		 285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  37.61 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  37.78 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  41.05 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  37.5 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  36.68 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  38.38 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  36.61 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  37.28 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  38.05 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  39.38 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  35.94 
 
 		 301 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  36.13 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  34.91 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  34.88 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  37.85 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  37.44 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  41.05 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  34.04 
 
 		 256 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.93 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34.38 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  36.82 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  39.82 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  35.42 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  34.04 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  42.27 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  37.61 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  34.12 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  38.03 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  34.94 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  37.5 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  34.31 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  35.04 
 
 		 281 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  37.5 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0232  glutamate racemase  37.18 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000508837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  31.82 
 
 		 267 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  38.97 
 
 		 266 aa  133  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  38.28 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  39.19 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0165  glutamate racemase  36.68 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000122262  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  31.72 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>