More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0940 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  82.2 
 
 		 276 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  70.5 
 
 		 270 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  66.15 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  68.25 
 
 		 282 aa  332  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  66.8 
 
 		 282 aa  329  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  63.85 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  66.28 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  64.5 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  64.73 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  62.93 
 
 		 270 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  62.16 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  60.67 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  62.31 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  64.6 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  64.91 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  61.98 
 
 		 310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  62.26 
 
 		 300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  64.15 
 
 		 285 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  59.57 
 
 		 293 aa  301  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  59.45 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  60.46 
 
 		 271 aa  295  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  62.78 
 
 		 268 aa  295  8e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  55.27 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  60 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  60 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  59.62 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  59.38 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  57.56 
 
 		 278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  59.13 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  56.4 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  45.14 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  45.14 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  45.14 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  45.14 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  45.14 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  45.14 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  45.14 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  44.75 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  44.75 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  44.36 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  44.49 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  47.83 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  47.86 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  42.91 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  41.38 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  47.43 
 
 		 276 aa  208  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  47.08 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  42.8 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  44.96 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  42.63 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  45.88 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  41.51 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  43.97 
 
 		 272 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  43.54 
 
 		 303 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  41.51 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  46.27 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  42.21 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  41.51 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  41.51 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  42.23 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  47.39 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  46.01 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  40.23 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  38.82 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  38.43 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  42.4 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  42.4 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  38.15 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  39.69 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  42.63 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  40.31 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  43.97 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  43.28 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  42.13 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  38.22 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  41.54 
 
 		 265 aa  185  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  44.02 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  37.55 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  40.65 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  42.32 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  42.32 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  39.41 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  41.22 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  40.38 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  38.58 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  36.82 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  41.28 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  42.08 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  41.31 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  41.6 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  45.24 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  37.45 
 
 		 295 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  41.77 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  40.45 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  37.9 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  41.37 
 
 		 272 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  37.3 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  45.85 
 
 		 259 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  44.66 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>