More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1080 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  100 
 
 		 292 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  76.03 
 
 		 287 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  75.68 
 
 		 287 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  77.22 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  77.22 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  77.22 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  77.15 
 
 		 290 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  76.78 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  76.78 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  76.4 
 
 		 290 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  76.4 
 
 		 290 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  73.99 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  76.4 
 
 		 290 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  76.4 
 
 		 290 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  77.57 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  71.43 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  72.26 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  70.34 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  61.02 
 
 		 280 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  59.84 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  60.63 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  54.75 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  54.75 
 
 		 270 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  49.81 
 
 		 268 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  52.92 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  50.95 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  55.66 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  47.98 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  48.43 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  54.3 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  49.4 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  47.71 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  47.53 
 
 		 265 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  48.61 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  51.04 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  52.08 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  52.1 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  44.98 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  47.01 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  51.87 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  49.77 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  45.53 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  47.45 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  44.08 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  43.52 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  39.13 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  45.66 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  44.44 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  41.77 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  38.74 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  47.75 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  48.98 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  43.89 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  46.45 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  46.45 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  45.56 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  43.42 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  49.15 
 
 		 279 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  39.37 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  42.96 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  46.52 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  49.08 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  50.47 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  37.45 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  43.33 
 
 		 271 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  43.18 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  40.08 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  41.77 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  45.45 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  37.5 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  42.32 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  41.67 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  39.69 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  40.23 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.76 
 
 		 281 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  41.41 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  40.6 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  40.78 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  34.65 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  40.15 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  33.47 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  40.16 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  39.92 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  41.52 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  39.45 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  41.41 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  41.6 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  41.6 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  41.44 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  35.32 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  40.89 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  39.42 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  41.38 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  37.95 
 
 		 265 aa  159  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.78 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  40.18 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  41.67 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  39.69 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  33.57 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>