More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0609 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  47.45 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  46.62 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  46.35 
 
 		 269 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  46.35 
 
 		 269 aa  242  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  46.35 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  46.35 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  46.35 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  46.35 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  45.45 
 
 		 264 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  45.99 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  45.99 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  44.74 
 
 		 271 aa  239  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  46.24 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  45.99 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  45.49 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  41.35 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  41.13 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  43.24 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  39.08 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  43.28 
 
 		 264 aa  208  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  41.8 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  41.85 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  38.95 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  45.02 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  43.07 
 
 		 272 aa  204  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  43.72 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  43.91 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  42.02 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  42.02 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  45.02 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  43.91 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  41 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  39.92 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  39.93 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  42.25 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  44.78 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  39.22 
 
 		 292 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  40.55 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  46.73 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  45.16 
 
 		 278 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  40.74 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  40.74 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  40.74 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  35.21 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  40.82 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  40.15 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  37.6 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  38.17 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  35.64 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  41.26 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  40.75 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  39.44 
 
 		 284 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  40.38 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  39.29 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  37.21 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  36.14 
 
 		 267 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  39.69 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  38.76 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  39.62 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  43.51 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  42.98 
 
 		 274 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  37.4 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  38.69 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  38.34 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  36.04 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  40.47 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  39.19 
 
 		 360 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  39.61 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  39.61 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  39.29 
 
 		 265 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  38.67 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  36.9 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  39.45 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  35.86 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  38.86 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  37.98 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  43.58 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  37.27 
 
 		 280 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  39.62 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  35.8 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  38.13 
 
 		 259 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  39.06 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  38.13 
 
 		 259 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  35.8 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  37.27 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  38.46 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  38.41 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  36.58 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  39.06 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  36.15 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  38.61 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  34.59 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  34.75 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  37.5 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  35.41 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.71 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  36.72 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  36.72 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  40.44 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>